ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Vrednotenje afinitete vezave represorja Tet na ciljno mesto DNA ob prisotnosti efektorja, podobnega transkripcijskemu aktivatorju (TALE) [A] = Assessment of Tet repressor binding affinity to cognate DNA target in the presence of transcription activator-like effector (TALE) [A] : enoviti magistrski študij farmacije
Dragovan, Matej
Efektorji, podobni transkripcijskim aktivatorjem (ang. transcription activator-like effectors, TALEs), so proteini, ki jih zaradi možnosti vezave na definirana vezavna mesta na polinukleotidni verigi ...na široko uporabljamo v sintezni biologiji. Sestavljajo jih številne kratke ponovitve aminokislinskih zaporedij (t.i. moduli oz. kanonične ponovitve iz 33 do 35 ostankov). Specifičnost TALE je mogoče urejati s spreminjanjem po dveh aminokislinskih ostankov v modulih, ki prepoznavajo in se vežejo na zaporedne nukleotide na eni od verig DNA. Poleg spajanja z efektorskimi domenami in urejanja DNA lahko vplivajo na nivo transkripcije, ki ga sproži drug transkripcijski dejavnik. S ciljem ovrednotiti afinetito vezave transkripcijskega dejavnika TetR ob hkratni vezavi proteina TALE [A] na DNA smo oba proteina izrazili v bakterijah Escherichia coli. Izolirali smo ju s kovinsko-kelatno afinitetno kromatografijo in dodatno prečistili z gelsko filtracijo. Pri tem smo z namenom optimizacije čiščenja preizkusili več različnih kromatografskih pufrov. Z analitsko gelsko filtracijo, sklopljeno z večkotnim sipanjem laserske svetlobe (SEC-MALS) ter s tehnikama dinamičnega sipanja svetlobe in poliakrilamidne gelske elektroforeze v prisotnosti natrijevega lavrilsulfata smo pokazali, da sta eksperimentalno določeni velikosti in molski masi primerljivi s teoretičnimi vrednostmi le teh in dokazali, da proteina med seboj ne interagirata. S testom zamika elektroforezne mobilnosti (ang. electrophoretic mobility shift assay, EMSA) smo določili disociacijsko konstanto TetR pri vezavi na DNA, medtem ko pri vezavi TALE [A] na DNA in vezavi TetR na DNA v prisotnosti TALE [A], nismo mogli določiti Kd zaradi nekonstantnosti vezave TALE [A] na DNA. Predpostavljamo, da so za to odgovorna različna konformacijska stanja rekombinantnega TALE [A].
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [M. Dragovan], 2022
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
