ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Sekvenciranje celotnega genoma bolnikov s hipogonadotropnim hipogonadizmom = Whole genome sequencing in patients with hypogonadotropic hypogonadism : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicina
Breznik, Nika, 1998-
Hipogonadotropni hipogonadizem (HH) je heterogena bolezen z variabilno klinično sliko, ki nastane zaradi nepravilnega razvoja olfaktorne plakode, nepravilnosti v migraciji nevronov GnRH in motenj v ...uravnavanju izločanja ali delovanja GnRH. Prirojeni HH delimo glede na zmožnost zaznave vonja na Kallmannov sindrom (KS) in normozmični idiopatski HH (nIHH). Opredelitev genetskega vzroka HH je pogosto težavna in v 50 % ostane nepojasnjena. V magistrsko nalogo smo vključili 20 preiskovancev iz 18 družin, pri katerih do sedaj uporabljeni genetski pristopi pri prepoznavanju genetskega vzroka bolezni niso bili uspešni. Klinična diagnoza KS je bila postavljena pri 15 preiskovancih, pri 5 preiskovancih je bila postavljena diagnoza nIHH. Dodatne klinične značilnosti so bile prisotne pri 13 preiskovancih, 12 preiskovancev pa je imelo pozitivno družinsko anamnezo. Pri vseh preiskovancih smo izvedli sekvenciranje celotnega genoma in nato analizirali spremembe posameznega nukelotida, manjše delecije, insercije in spremembe v številu kopij izbranih 366 genov ter tako poskušali opredeliti genetski vzrok bolezni. Pri preiskovancih, pri katerih smo imeli podatke celotnega genoma tudi za družinske člane, smo analizirali intronska področja osnovnega nabora 34 genov, ki so znano povezani s HH. Kot potrditveno metodo za opredelitev družinske segregacije sprememb smo uporabili sekvenciranje po Sangerju. Genetsko etiologijo smo dokončno pojasnili pri 30 % (6/20) preiskovancev in delno pri dodatnih 45 % (9/20) preiskovancev. Pri preiskovancih smo opredelili devet novih genetskih sprememb v genih ANOS1, CCDC141, FGFR1, IGSF10, PROK2, SEMA3A, SEMA3G in SPRY4, ki so znani vzročni geni za HH. Identificirali smo tudi spremembo v kandidatnem genu LGR4, ki do sedaj še ni bil povezan s HH. Pri samo 2 preiskovancih nismo prepoznali sprememb, ki bi lahko pojasnile nastanek klinične slike HH. Pri 3 preiskovancih iz iste družine smo v genu FGFR1 identificirali globoko intronsko spremembo, ki bi lahko bila vzrok za nastanek klinične slike pri tej družini, a glede na obstoječe podatke to težko opredelimo. Globoke intronske spremembe do sedaj še niso bile prepoznane pri bolnikih s HH. Genetska diagnostika HH je zahtevna zaradi velike heterogenosti, oligogenosti in nepopolne penetrance patoloških sprememb, kar je bilo ugotovljeno tudi pri naši skupini bolnikov.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [N. Breznik], 2023
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
