ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Vpliv prekomernega izražanja strukturnih proteinov M, N, S in E ter pomožnega proteina ORF6 virusa SARS-CoV-2 na izražanje genov iz družine APOBEC v človeških celičnih linijah HuH-7 in HeLa = The effect of SARS-CoV-2 virus structural proteins M, N, S, E and accessory protein ORF6 overexpression on the APOBEC gene family expression in human HuH-7 and HeLa cell lines : magistrska naloga laboratorijska biomedicina
Levačič, Patrik
Proteini APOBEC so citidinske deaminaze, skupina encimov, ki deaminirajo citidine v uridine na enojnoverižnih polinukleotidih. Njihova osnovna funkcija je urejanje RNA molekul, vendar lahko nekateri ...od teh proteinov urejajo tudi DNA molekule in s tem sodelujejo v procesih, ki vplivajo na genomsko variabilnost. Proteini APOBEC so protivirusni proteini in preprečijo razmnoževanje različnim RNA virusom, DNA virusom in retroelementom. Povezava med proteini APOBEC in virusom SARS-CoV-2 izhaja iz raziskav, ki so razkrile, da ti proteini lahko vplivajo na genom virusa. Med virusno okužbo se lahko izražanje APOBEC genov spremeni, kar lahko privede do nastanka mutacij v genomu SARS-CoV-2. Te mutacije lahko vplivajo na lastnosti virusa, kot je npr. sposobnost razmnoževanja, izmikanje imunskemu sistemu ali odpornost na zdravila. Poleg tega mutacije v genomu virusa prispevajo k njegovi evoluciji in pospešijo nastanek novih sevov ter s tem vplivajo na razširjenost virusa v populaciji. Izražanje genov iz družine APOBEC je običajno povišano med virusno okužbo, vendar ni popolnoma jasno, kakšen je vpliv na izražanje teh genov pri virusu SARS-CoV-2. Zato smo se v nalogi osredotočili na preučevanje vpliva prekomernega izražanja proteinov SARS-CoV-2 na izražanje genov APOBEC. V ta namen smo uporabili sesalski celični liniji, Huh-7 (izvorno izhaja iz hepatocelularnega tumorja) in HeLa (izvorno izhaja iz raka materničnega vratu). Sesalske celice smo transfecirali z različnimi plazmidnimi vektorji, ki so vsebovali zapis za strukturne proteine M, N, S, E in pomožni protein ORF6 virusa SARS-CoV-2 in s kvantitativno verižno reakcijo s polimerazo v realnem času (qPCR) izmerili nivo izražanja genov A1, A3A, A3B, A3C, A3D, A3F in A3G. Pri celični liniji Huh-7 je pri prekomernem izražanju strukturnega proteina N in pomožnega proteina ORF6 prišlo do znižanja izražanja gena A1, pri ostalih genih vpliv prekomernega izražanja proteinov SARS-CoV-2 na izražanje genov APOBEC nismo uspeli dokazati. Pri celični liniji HeLa vpliv prekomernega izražanja proteinov SARS-CoV-2 na izražanje genov iz družine APOBEC prav tako nismo uspeli dokazati. Rezultati raziskovalnega dela so pokazali, da prekomerno izražanje strukturnega proteina N in pomožnega proteina ORF6 zniža izražanje gena A1 in so v nasprotju s pričakovanji, saj naj bi se izražanje genov APOBEC med virusno okužbo zvišalo. Za boljše razumevanje vpliva na izražanje teh genov so potrebne nadaljnje raziskave.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [P. Levačić], 2023
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
