ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Določanje alelne frekvence polimorfizmov farmakogena NUDT15 v slovenski populaciji = Determination of allelic frequency of pharmacogene NUDT15 polymorphisms in the Slovenian population : Uniform Master's Study Programme Pharmacy
Kastelic, Helena, farmacevtka
Akutna limfoblastna levkemija (ALL) je bolezen, pri kateri pride do nenormalnega razraščanja nezrelih celic limfocitne vrste (limfoblastov). Za njeno zdravljenje se uporabljajo tiopurini, učinkovine ...z imunosupresivnim in citostatičnim delovanjem, med katere sodijo 6-tiogvanin (6-TG), 6-merkaptopurin (6-MP) in azatioprin (AZA). Pri odzivu na zdravljenje z njimi imajo pomembno vlogo polimorfizmi v genu za nudiks hidrolazo 15 (NUDT15), ki lahko vodijo v njihovo večjo toksičnost. Želeli smo ugotoviti frekvence polimorfizmov v genu NUDT15 (rs61746486, rs45465203, rs61973267, rs116855232), ki smo jih predhodno identificirali pri bolnikih zdravljenih s tiopurini, in jih preko določitve vrednosti MAF opredeliti kot farmakogenetske diagnostične kazalce v slovenski populaciji. Preverili smo njihovo skladnost s frekvencami v drugih populacijah in izračunali, ali se v slovenski populaciji nahajajo v Hardy-Weinbergovem ravnovesju. Identificirali smo tudi druge polimorfizme v kodirajočih regijah NUDT15. Raziskali smo, ali napovedni bioinformacijski modeli predpostavljajo vključenost identificiranih polimorfizmov pri odzivu na zdravljenje s tiopurini. Iz krvi zdravih preiskovancev smo izolirali DNA in preverili njeno kakovost. Izvedli smo verižno reakcijo s polimerazo (ang. polimerase chain reaction, PCR) ter ekson 1 in ekson 3 z okolico sekvencirali po Sangerju. Z uporabo bioinformacijskih orodij smo preverili frekvence teh polimorfizmov v drugih populacijah ter vrednotili njihove posledice na funkcijo proteinskega produkta NUDT15. Iz rezultatov lahko sklenemo, da bi bilo pred začetkom zdravljenja smiselno določanje polimorfizmov rs45465203 in rs61973267. Frekvenci polimorfizmov rs45465203 in rs61973267 sta v slovenski populaciji nižji kot v evropski in višji kot v vzhodnoazijski in afriški. Polimorfizma rs61746486 in rs116855232 sta v slovenski populaciji bolj razširjena kot v evropski, vendar je frekvenca polimorfizma rs116855232 bistveno višja med prebivalci azijskih držav. Izračunali smo, da so populacije vseh preiskovanih polimorfizmov v Hardy-Weinbergovem ravnovesju. Dodatno smo identificirali polimorfizma rs79687000 in rs1249937565, ki pa jih zaradi pomanjkanja podatkov o populacijski genetiki nismo mogli primerjati z drugimi populacijami. Z uporabo napovednih modelov smo ugotovili, da bi polimorfizmi rs45465203, rs79687000, rs124937565 in rs61973267 potencialno lahko vplivali na funkcijo proteina. Vpeljava polimorfizma rs116855232 v diagnostični panel pa bi bila kljub nizki vrednosti MAF v slovenski populaciji smiselna zaradi njegove navedbe v CPIC priporočilih.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [H. Kastelic], 2024
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
