ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Identifikacija novih zaviralcev MurA in MurB s pomočjo virtualnega rešetanja na osnovi strukture liganda in uporabe grafičnih kartic = Identification of novel MurA and MurB inhibitors by graphics processing unit-supported ligand-based virtual screening : Master's Study Programme Industrial Pharmacy
Adamič, Anja
Odkrivanje in razvoj novih protibakterijskih učinkovin je zahtevna naloga farmacevtske industrije. Ob klinični praksi in široki uporabi protibakterijskih učinkovin se ni mogoče izogniti pojavu ...rezistence bakterij. Zaskrbljujoče je dejstvo, da se pojavljajo sevi, odporni na več protibakterijskih učinkovin hkrati, od teh so izpostavljeni ESKAPE organizmi, kamor spadajo Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa in Enterobacter spp. S tem razlogom je ključen izziv v razvoju iskanje novih, strukturno različnih zdravilnih učinkovin, z novimi mehanizmi delovanja in uporaba novih terapevtskih tarč. Ena izmed najpomembnejših tarč pri razvoju protibakterijskih učinkovin je bakterijska celična stena oziroma encimi, ki sodelujejo v biosintezi le-te. Zaradi esencialne vloge sta tako atraktivni tarči v razvoju novih učinkovin encima MurA in MurB, za katera je bilo v literaturi opisanih več strukturno različnih spojin z zaviralno aktivnostjo nanju. Zaradi slabih fizikalno-kemijskih lastnosti spojin je tako do klinične uporabe prešla samo zdravilna učinkovina fosfomicin, ki zavira delovanje MurA. Sodobna računalniška tehnologija nam omogoča hitrejše načrtovanje novih učinkovin, zato smo se pri odkrivanju posvetili uporabi najmodernejših metod virtualnega rešetanja na osnovi liganda. Uporabili smo in silico programe, ki so prilagojeni uporabi grafičnih kartic in so nam omogočili uporabo večmilijonske knjižnice spojin za virtualno rešetanje. V magistrskem delu opisujemo uporabo programov ROCS in FastROCS ter primerjamo njuno uporabo na manjši in obsežnejši knjižnici spojin. Oba programa delujeta podobno in med rezultate virtualnega rešetanja na osnovi liganda identificirata enake skelete, ne glede na obseg podatkov. Z uporabo večje knjižnice spojin dobimo bolj prilegajoče se zadetke izhodnim spojinam v primerjavi z manjšo bazo. Kemijska pestrost skeletov rezultatov pa je višja pri manjši knjižnici spojin, saj je prisoten višji delež unikatnih delov struktur skeletov kot pri rezultatih obsežnejše knjižnice. Najbolje ovrednotene spojine predlagamo za nadaljnje biološko testiranje njihovega zaviranja MurA in MurB.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [A. Adamič], 2019
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
