ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Načrtovanje fosforilacijske signalne poti v sesalskih celicah = Design of phosphorylation signaling pathways in mammalian cells : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicina
Kodila, Anja
Eden izmed pomembnih ciljev sintezne biologije je vnos novih signalnih poti, kot je primer imunoterapije s CAR-T celicami za zdravljenje raka. Zaradi potrebe po hitrejših celičnih odzivih na vhodni ...signal, se sintezna biologija vedno bolj osredotoča na uravnavanje bioloških sistemov na posttranslacijskem nivoju, kot sta proteoliza in fosforilacija. V magistrskem delu smo načrtovali koncept uravnavanja aktivnosti tarčnega proteina s fosforilacijo. V ta namen smo v poročevalski protein kresničkina luciferaza vstavili zaporedje za SH2 vezavno domeno ter substratni peptid, ki ga ustrezna kinaza prepoznava in fosforilira. Z opisano manipulacijo smo dosegli, da je tarčni protein v osnovnem stanju neaktiven, fosforilacija le-tega z ustrezno kinazo pa mu aktivnost povrne. Za preverjanje najbolj optimalnega razmerja med neaktivnim in aktivnim stanjem kresničkine luciferaze smo pripravili serijo konstruktov, ki so se med seboj razlikovali po drugačnih pozicijah vstavljenih fosfopeptidnih domen in substratnih peptidov, ter različnih dolžinah povezovalnih segmentov. Načrtovali smo dva enomolekulska konstrukta; razcepljeno luciferazo z vstavljeno fosfopeptidno domeno in substratnim peptidom med N in C koncem in razcepljeno luciferazo z vstavljenim substratnim peptidom med N in C koncem, ter fosfopeptidno vezavno domeno vezano na C konec s fleksibilnim povezovalnikom. Uspešnost koncepta smo preverjali s kinazama Lyn in Lck, ki sta članici družine Src nereceptorskih tirozinskih kinaz in sta zaradi svoje vloge v patoloških procesih privlačni terapevtski tarči. V magistrskem delu smo z načrtovanjem od fosforilacije odvisne aktivnosti tarčnega proteina zasnovali temelje za oblikovanje sintetične fosforilacijske kaskade v sesalskih celicah, katera ima dve poglavitni prednosti, in sicer (i) hiter odziv na signale iz okolja ter (ii) reverzibilnost. Sistem je zasnovan modularno, to pomeni, da je razširljiv in omogoča načrtovanje logičnih funkcij, fosforilacijskih kaskad ter pozitivnih in negativnih povratnih zank.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [A. Kodila], 2021
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
