Naloga vključuje molekularno-biološko določanje sorodnosti tipskih sevov in drugih izolatov askomicetnih kvasovk rodov ▫{\sl Saccharomyces, Torulaspora, Debaryomyces, Zygosaccharomyces, Arxiozyma in ...Pachytichospora}▫ s štirimi genotipizacijskimi tehnikami: elektroforetsko kariotipizacijo in hibridizacijsko analizo kariotipov, pomnoževanjem DNA kvasovk z naključno izbranimi začetnimi oligonukleotidi, PCR ribotipizacijo in restrikcijsko analizo mtDNA. Na osnovi enotne obdelave elektroforetskih in hibridizacijskih vzorcev z računalniškim programom NTSYS so izračunani koeficienti podobnosti med izolati in podana primerjava tehnik za vrednotenje sorodnosti izolatov in njihovo hitro identifikacijo. Vse metode dajejo zelo podobne ocene sorodnosti med analiziranimi kvasovkami, območje zanesljive uporabnosti pa je različno. Polimorfizem restrikcijskih vzorcev mtDNA, AP-PCR in elektroforetska kariotipizacija omogočajo dobro razlikovanje zelo sorodnih sevov znotraj iste vrste, PCR ribotipizacija pa omogoča primerjavo med različnimi vrstami in rodovi. Kvasovke rodu ▫{\sl Saccharomyces}▫ in ▫{\sl Pachytichospora}▫ vsebujejo 7-16 kromosomov, pri kvasovkah ostalih rodov smo ugotovili največ 6 ločenih elektroforetskih fragmentov. Naloga vključuje podrobnejšo analizo strukture mtDNA izbranih kvasovk. Izračunane so povprečne dolžine mtDNA enajstih tipskih sevov in štirih rodov kvasovk. ▫{\sl Saccharomyces}▫ sensu stricto kvasovke imajo v 65 - 80 kb dolgih mtDNA molekulah 25-45 restrikcijskih mest endonukleaze ▫{\sl Hae}▫III in ▫{\sl Msp}▫I, ki cepita v GC otokih, in 4-8 ▫{\sl ori-rep-tra}▫ zaporedij. Vse druge analizirane kvasovke imajo krajši mitohondrijski genom (cca 23,0 - 50,0 kb), vsebujejo bistveno manj restrikcijskih mest v GC otokih in ne hibridizirajo z ▫{\sl ori-rep-tra}▫ sondo iz mtDNA ▫{\sl Sacch. cerevisiae}▫. Visoko frekvenco spontanih in z etidijevim bromidom (EtBr) induciranih petite mutacij imajo sevi, ki vsebujejo dolge mtDNA s številnimi otoki. Tudi izolati,ki nimajo tako številnih GC otokov (▫{\sl Sacch}▫. sensu lato), mutirajo, a je inducibilnost z EtBr bistveno manjša. Sevi iz rodu ▫{\sl Torulaspora}▫ so petite-negativni. Velikost mitohondrijskih genomov teh kvasovk je približno 30 - 32 kb, njihova vsebnost G+C pa 22,0-28,5 mol%. Z restrikcijsko analizo s trinajstimi restrikcijskimi endonukleazami in hibridizacijo z devetimi gensko specifičnimi sondami iz mtDNA je izdelana kompletna (▫{\sl T'spora delbrueckii}▫) oz. delna (▫{\sl t'spora globosa}▫ in ▫{\sl T'spora pretoriensis}▫) restrikcijska in genska karta mitohondrijskega genoma. Na osnovi kloniranih fragmentov iz ribosomskih genov mtDNA je bilo določeno identično nukleotidno zaporedje kratkih odsekov (196 bp) na obeh koncih ▫{\sl Sal}▫I-▫{\sl Sph}▫I fragmenta vseh treh tipskih sevov ▫{\sl Torulaspora}▫ kvasovk. Jedrni in mitohondrijski genomi kvasovk ▫{\sl Saccharomyces}▫ so mnogo bolj raznoliki kot genomi kvasovk ▫{\sl Torulaspora}▫.
Type of material - dissertation
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [S. Smole Možina], 1996
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
Izposojeno gradivo lahko vrnete tudi v nabiralnik pred knjižnico.