(UL)
-
Primerjalno vrednotenje masne spektrometrije in multipleksne verižne reakcije s polimerazo v realnem času za identifikacijo dermatofitov = Comparative evaluation of mass spectrometry and multiplex real time polymerase chain reaction for dermatophyte identification : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicina : Masters Study Program Laboratory BiomedicineRadež, MancaDermatofiti so vlaknate glive, ki večinoma povzročajo površinske okužbe kože, las in nohtov. Laboratorijska diagnostika teh okužb temelji na neposrednem mikroskopskem pregledu kužnin, njihovem ... gojenju na mikoloških gojiščih in identifikaciji na podlagi morfoloških lastnosti. Klasična identifikacija zahteva izkušnje in čas, zato v diagnostiko uvajamo hitrejše in objektivnejše metode prepoznavanja dermatofitov. Namen magistrske naloge je bil primerjati masno spektrometrijo (MS) MALDI-TOF (angl. matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight) in multipleksne verižne reakcije s polimerazo v realnem času (qPCR) za identifikacijo dermatofitov ter opredeliti ustreznost obeh metod za prepoznavo najpogostejših povzročiteljev dermatofitoz. Poleg tega je bil cilj naloge tudi uvesti protokol, s katerim bi dopolnili morfološko prepoznavanje dermatofitov, skrajšali čas do izvida in zmanjšali možnost subjektivnih napak. Izboljšati smo želeli tudi predpripravo vzorcev in omogočiti zanesljivejšo identifikacijo dermatofitov z metodo MS MALDI-TOF tako, da smo primerjali rezultate analiziranih kultur, ki so zrasle na dveh različnih dermatofitnih gojiščih. Uporabili smo 103 pozitivne vzorce, ki so jih v Laboratoriju za diagnostiko glivičnih infekcij na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani prejeli v diagnostično testiranje. Vzorce smo najprej nacepili na dve različni trdni gojišči, in sicer sulfit-cikloserin-azidni agar (SCA) in ID-Fungi Plates ter v tekoče gojišče tioglikolatni bujon (TIO). Po 3-5 dneh smo s trdnih gojišč postrgali dermatofitne kulture in jih nanesli na ploščico za analizo z metodo MS MALDI-TOF. Iz tekočega gojišča TIO pa smo izolirali dermatofitno DNA in jo do analize z qPCR shranili v hladilniku pri -20 %. Multipleksno PCR v realnem času smo izvedli s komercialno dostopnim kompletom DermaGenius 2.0. Po primerjavi in statistični analizi rezultatov analiz smo ugotovili, da je bila analizna specifičnost MS MALDI-TOF MS večja, če smo namesto gojišča SCA za gojenje dermatofitov uporabili gojišče ID-Fungi Plates. Poleg tega smo ugotovili, da je analitska specifičnost multipleksne metode qPCR v realnem času boljša kot pri MS MALDI-TOF, saj smo z njo lahko pravilno identificirali večje število dermatofitov z manjšim številom neuspešnih prepoznav. Zato menimo, da bi bila metoda multipleksne qPCR primerna za dopolnitev klasične diagnostike. Za ustrezno verifikacijo metode pa bi morali izvesti dodatno raziskavo, s katero bi lahko zanesljivo opredelili vse parametre, ki so ključni za vpeljavo novih metod v standardne operativne postopke rutinskega diagnostičnega laboratorija.Type of material - master's thesis ; adult, seriousPublication and manufacture - Ljubljana : [M. Radež], 2021Language - slovenianCOBISS.SI-ID - 63103747
Author
Radež, Manca
Other authors
Jeras, Matjaž |
Matos, Tadeja
Topics
Dermatologija |
Laboratorijska diagnostika |
dermatofiti |
metoda MS MALDI-TOF |
metoda multipleksne PCR v realnem času |
identifikacija |
dermatofitno gojišče
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Library | Call number – location, accession no. ... | Copy status |
---|---|---|
Faculty of Pharmacy, Lj. | Knjižnica mlab 616 RADEŽ MANCA Primerjalno 258 IN: 0017126 |
available - reading room |
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
If the library membership card is not in the list,
add a new one.
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Radež, Manca | ![]() |
Jeras, Matjaž | 01302 |
Matos, Tadeja | 18993 |
Source: Personal bibliographies
and: SICRIS
Select pickup location:
Material pickup by post
Delivery address:
Address is missing from the member's data.
The address retrieval service is currently unavailable, please try again.
By clicking the "OK" button, you will confirm the pickup location selected above and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the above pickup location and delivery address, and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the address selected above and complete the reservation process.
Notification
Automatic login and reservation service currently not available. You can reserve the material on the Biblos portal or try again here later.
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Reservation in progress
Please wait a moment.
Reservation was successful.
Reservation failed.
Reservation...
Membership card:
Pickup location: