Deux gènes paralogues de la bactérie Lactobacillus johnsonii NCC533 (La1), issue de la collection de culture Nestlé, montrent une forte similitude avec le gène de Lactobacillus gasseri 4B2 codant une protéine appelée " aggregation promoting factor " (APF). Ces deux gènes ont été clonés et caractérisés. L'analyse transcriptionnelle a montré que le taux d'expression des deux gènes est maximal durant la phase exponentielle de croissance, alors que ce taux est très faible durant la phase stationnaire. Les deux gènes sont fortement induits lorsque L. johnsonii NCC533 se développe sur un milieu solide en comparaison à la croissance en milieu liquide. La surexpression des gènes apf de la souche L. gasseri 4B2 et de la souche L. johnsonii NCC533, dans la souche L. johnsonii NCC533, ne conduit pas à un phénotype visible. Cependant, après introduction de ces mêmes constructions de surexpression chez L. gasseri 4B2, nous pouvons observer une augmentation significative du phénotype d'agrégation de cette bactérie ainsi qu'un changement de sa forme cellulaire, montrant ainsi que le phénotype résultant de la protéine APF est dépendante de la souche utilisée. Ces données indiquent que la protéine APF n'est pas seulement impliquée dans le phénomène d'agrégation, mais influence aussi, de manière directe ou indirecte, la forme cellulaire finale de L. gasseri 4B2