VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
-
Evaluation of DNA extraction methods for reliable quantification of Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, and Pseudomonas aeruginosa [Elektronski vir]Bogožalec Košir, Alexandra ...Detection and quantification of DNA biomarkers relies heavily on the yield and quality of DNA obtained by extraction from different matrices. Although a large number of studies have compared the ... yields of different extraction methods, the repeatability and intermediate precision of these methods have been largely overlooked. In the present study, five extraction methods were evaluated, using digital PCR, to determine their efficiency in extracting DNA from three different Gram-negative bacteria in sputum samples. The performance of two automated methods (GXT NA and QuickPick genomic DNA extraction kit, using Arrow and KingFisher Duo automated systems, respectively), two manual kit-based methods (QIAamp DNA mini kit; DNeasy UltraClean microbial kit), and one manual non-kit method (CTAB), was assessed. While GXT NA extraction kit and the CTAB method have the highest DNA yield, they did not meet the strict criteria for repeatability, intermediate precision, and measurement uncertainty for all three studied bacteria. However, due to limited clinical samples, a compromise is necessary, and the GXT NA extraction kit was found to be the method of choice. The study also showed that dPCR allowed for accurate determination of extraction method repeatability, which can help standardize molecular diagnostic approaches. Additionally, the determination of absolute copy numbers facilitated the calculation of measurement uncertainty, which was found to be influenced by the DNA extraction method used.Vir: Biosensors. - ISSN 2079-6374 (Vol. 13, iss. 4, art. 463, Apr. 2023, str. [1]-15)Vrsta gradiva - e-članek ; neleposlovje za odrasleLeto - 2023Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 149291011
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Avtor | Bogožalec Košir, Alexandra ... |
Naslov | Evaluation of DNA extraction methods for reliable quantification of Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, and Pseudomonas aeruginosa [Elektronski vir] |
Datum objave | 2023-04-06 |
COBISS.SI-ID | 149291011 |
Verzija objave v repozitoriju | Založnikova različica |
Licenca objave v repozitoriju | Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna |
Embargo | Takojšnja javna objava |
Projekti, iz katerih je bila financirana objava
Naziv | Akronim | Številka projekta | Financer |
---|---|---|---|
Biotehnologija in sistemska biologija rastlin | P4-0165-2022 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Meroslovje za sledenje bolnišničnih okužb respiratornega trakta, ki jih povzročajo Gram-negativne bakterije | Z2-1860-2019 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
Datoteke, ki spadajo k objavi
Povezava |
---|
![]() |
![]() |
![]() |
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Bogožalec Košir, Alexandra | 37410 |
Lužnik, Dane | 34498 |
Tomič, Viktorija | 22806 |
Milavec, Mojca, 1972- | 19119 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: