Akademska digitalna zbirka SLovenije - logo
VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Proučevanje vezave zaviralcev Hsp90 v alosterično vezavno mesto izoform Hsp90α in Hsp90β z molekulskim sidranjem = Studying binding modes of Hsp90 inhibitors in the allosteric binding site of Hsp90α and Hsp90β isoforms by molecular docking : magistrski študijski program Industrijska farmacija
    Avdičević, Amela
    Proteini toplotnega šoka 90 (Hsp90) so šaperoni, katerih glavna naloga je pomagati proteinom zavzeti ustrezno nativno konformacijo, s čimer postanejo funkcionalni. Sodelujejo tudi v drugih celičnih ... procesih, kot so nadzor celičnega cikla, signalizacija, sposobnost preživetja celic, apoptoza in razgradnja proteinov. Pri fizioloških pogojih so v celicah prisotni v nizkih koncentracijah, pod stresnimi pogoji (kot so povišana temperatura, UV sevanje, izpostavljenost mrazu itd.) pa se njihova ekspresija poveča kot odziv na celični stres. Posledično so močno izraženi tudi v rakavih celicah, v katerih stabilizirajo konformacijsko nestabilne in napačno zvite proteine ter jim tako omogočajo preživetje, zato so zaviralci Hsp90 potencialne protirakave učinkovine. V sklopu magistrske naloge smo proučevali vezavo izbranih zaviralcev Hsp90 v alosterično vezavno mesto izoform Hsp90α in Hsp90β s pomočjo molekulskega sidranja, s katerim smo lahko napovedali orientacijo, položaj in konformacijo liganda vezanega v vezavnem mestu proteina ter ocenili njegovo aktivnost in selektivnost med izoformama. Kot izhodišče smo najprej pripravili knjižnico zaviralcev Hsp90 že sintetiziranih in ovrednotenih na Univerzi v Ljubljani, Fakulteti za farmacijo. Spojinam smo nato izračunali fizikalno-kemijske lastnosti. Na podlagi slednjih ter že znanih vrednosti antiproliferativnega delovanja zaviralcev v rakavih celičnih linijah (MCF-7, Sk-Br3 in SK-N-MC) smo izbrali spojine, ki bi se lahko pokazale kot optimalne za nadaljnje delo. Sledila je validacija programov za sidranje, s katero smo preverili, katerega od računalniških programov (Glide, Autodock 4.2 in AutodockVina) je najbolje uporabiti za sidranje spojin. Tako smo izbrane spojine TZZ-103, TZZ-122, TZZ-151, TMT-11, TJD-54, TMM-7b in TMM-17 sidrali z računalniškim programom Glide, za katerega smo ugotovili, da je najustreznejši in na osnovi dobljenih rezultatov ocenili vezavno konformacijo in selektivnost zaviralcev za posamezno izoformo. Kot selektivne so se izkazale spojine TZZ-151, TMT-11 ter TMM-7b, vendar bi to bilo potrebno potrditi tudi eksperimentalno. Rezultati magistrske naloge so pomemben korak k razumevanju vezave alosteričnih zaviralcev Hsp90 in njihove selektivnosti med izoformama Hsp90α in Hsp90β.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [A. Avdičević], 2023
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 152930051

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...