Akademska digitalna zbirka SLovenije - logo
VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Uvedba sistema BglBrick za združevanje genov v mlečnokislinskih bakterijah Lactococcus lactis = Introducing BglBrick gene assembly in lactic acid bacteria Lactococcus lactis : enovit magistrski študij farmacija
    Ključevšek, Tim
    Mlečnokislinske bakterije so kot celične tovarne pomemben ekspresijski sistem za pridobivanje in dostavo proteinov. Ker imajo znaten biotehnološki potencial in zanimanje zanje narašča, se pojavlja ... potreba za razvoj novih orodij, ki bi izboljšala njihovo gensko spreminjanje. V zadnjih dveh desetletjih so razvili mnogo novih sistemov za združevanje genov, ki so olajšali in izboljšali sestavljanje genskega materiala. Standard BglBrick je ena od tovrstnih na novo razvitih metod, ki se je pojavila z optimizacijo in razvojem sistema BioBrick za združevanje genov. Temelji na ponovljivih restrikcijah in ligacijah z uporabo dveh različnih restrikcijskih endonukleaz, ki generirata kompatibilna kohezivna lepljiva konca. Ta po združitvi tvorita t. i. brazgotino v zaporedju DNA, ki je zato prej uporabljena encima ne moreta več razrezati. Sistem BglBrick za združevanje genov je bil prvotno razvit za bakterijo Escherichia coli, v okviru te magistrske naloge pa smo ga želeli prilagoditi za modelno mlečnokislinsko bakterijo Lactococcus lactis. Na osnovi plazmida pNZ8148 smo pripravili nov plazmid pNBBX, ki izkorišča restrikcijski endonukleazi BglII in BclI za tvorbo lepljivih koncev z zaporedjem GATC. Plazmid pNBBX kodira kaseto NheI-BglII-gen-BclI-XhoI, pri sestavljanju dveh kaset pa med njima nastane brazgotina TGATCT. Za preverjanje izražanja genov v plazmidu pNBBX smo uporabili tri modelne proteine: infrardeči fluorescentni protein, luciferazo NanoLucTM in afinitetno telo za receptor človeškega epidermalnega rastnega dejavnika 2. V pripravljen plazmid pNBBX smo z uporabo klasičnega kasetnega kloniranja vstavili gene za omenjene tri modelne proteine. Njihovo izražanje smo določali z merjenjem fluorescence in luminiscence ter z analizo s pretočno citometrijo. Izražanje proteinov smo ugotavljali tudi s poliakrilamidno gelsko elektroforezo, v prisotnosti natrijevega dodecilsulfata, ki sta ji sledili analizi gela s prenosom po westernu in z barvanjem z barvilom Coomassie Briliant Blue. Uspešno smo potrdili izražanje vseh treh modelnih proteinov. Sistem BglBrick smo uporabili za združitev več genov v istem plazmidu BglBrick in preverili njihovo sočasno izražanje, vendar smo bili pri tem neuspešni. Elektroferogrami, ki smo jih naredili po določevanju nukleotidnega zaporedja plazmidov so namreč vsebovali več istočasnih signalov, kar nakazuje na kontaminacijo plazmidnih vzorcev.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [T. Ključevšek], 2020
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 22262531

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...