Akademska digitalna zbirka SLovenije - logo
VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Aeromicrobium choanae sp. nov., nova vrsta aktinobakterije, izolirana iz sapišča vrtne penice : magistrsko delo
    Ber, Polona
    V okviru preiskovanja bakterijske mikrobiote sapišč izbranih vrst ptic, je bil v predhodnih raziskavah iz sapišča vrtne penice (Sylvia borin) izoliran sev 9H-4 (Matjašič, 2016). Na osnovi delne ... sekvence gena za 16S rRNA je bil sev uvrščen v rod Aeromicrobium. Z namenom, da določimo njegov natančen taksonomski položaj, smo ga v pričujočem magistrskem delu nadalje okarakterizirali z različnimi fenotipskimi in genotipskimi pristopi. Analiza celotnega nukleotidnega zaporedja genov za 16S rRNA je pokazala, da sev 9H-4 spada v rod Aeromicrobium z najbližjima sorodnima vrstama Aeromicrobium flavum in Aeromicrobium tamlense. Na osnovi sekvenc genov za 16S rRNA smo med vrstami iz rodu Aeromicrobium izračunali filogenetske odnose z metodo združevanja sosedov in konstruirali filogenetsko drevo. Sev 9H-4 v filogenetskem drevesu oblikuje samostojno vejo, dobro ločeno od najbolj sorodnih vrst. S preiskovanjem fenotipskih lastnosti seva 9H-4 smo ugotovili, da se ta sev od vrst A. flavum in A. tamlense razlikuje v sposobnosti hidrolize kazeina in pozitivni aktivnosti encimov ▫$\beta$▫ -galaktozidaze ter valin arilamidaze. S tankoplastno kromatografijo smo preiskali hidrolizat celične stene seva 9H-4 in ugotovili, da je sestavina peptidoglikana LL-diaminopimelična kislina. Nadaljnja primerjava genoma seva 9H-4 z genomoma referenčnih sevov Aeromicrobium flavum DSM 19355T in Aeromicrobium tamlense DSM 19087T na osnovi DNA-DNA hibridizacije, ki je bila narejena v sodelovanju z raziskovalno skupino iz zbirke mikroorganizmov BCCM/LMG v Belgiji, je odkrila manj kot 70% podobnosti z obema vrstama. Slednja analiza je potrdila, da Aeromicrobium sp. 9H-4 predstavlja novo vrsto bakterije. Sev 9H-4T smo opisali kot tipski sev za novo vrsto Aeromicrobium choanae (Ber in sod., 2017).
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Maribor : [P. Ber], 2017
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 23423496

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Miklošičeva knjižnica - FPNM, Maribor Maribor PEFMB v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...