Akademska digitalna zbirka SLovenije - logo
VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Načrtovanje, izražanje in ovrednotenje heterodimernih obvitih vijačnic na osnovi tropomiozina = Design, production and characterization of tropomyosin based coiled-coil dimers
    Mežnaršič, Eva
    Dobro poznavanje pravil zvijanja različnih naravnih proteinov nam omogoča načrtovanje proteinskih nanostruktur, kakršnih ne najdemo v naravi, de novo. Nove strukture lahko uporabimo v medicini, ... kemiji in biotehnologiji, npr. za ciljano dostavo zdravil v tkiva, razvoj cepiv, tkivno inženirstvo, načrtovanje biosenzorjev, biokatalizo in razvoj bionanomaterialov. Za načrtovanje de novo dovolj dobro poznamo le nekaj manjših naravnih domen proteinov, ki jih lahko uporabimo kot module za sestavljanje večjih poliedrskih nanostruktur. Proteinski origami je primer modularne topološko pogojene nanostrukture, sestavljene iz obvitih vijačnic, ki predstavljajo module. Posamezni moduli interagirajo izključno s svojim načrtovanim partnerjem in se tako zvijejo v načrtovano strukturo. Obvite vijačnice so polipeptidna zvitja dveh verig, za katera je značilen vzorec sedmih aminokislinskih ostankov, imenovanih heptade. V sklopu magistrskega dela smo načrtovali, izrazili in ovrednotili tri obvite vijačnice: Tropo-Cn6/Tropo-Dn6, Tropo-Cn12/Tropo-Dn12 in Tropo-Cn14/Tropo-Dn14. Te so del pete generacije heterodimernih obvitih vijačnic, dolgih 15 heptad, na osnovi tropomiozina, načrtovanih na Kemijskem inštitutu. V peti generaciji smo izbrali najbolj obetaven par iz četrte generacije in uvedli spremembe v devet prej nemodificiranih heptad. Velikost načrtovanih polipeptidov smo določili z metodo dinamičnega sipanja svetlobe (DLS) in ugotovili, da se je skladala s predvideno velikostjo okoli 15 nm. Delež sekundarne vijačne strukture smo ugotavljali z metodo cirkularnega dikroizma (CD). Pri paru Tropo-Cn6/Tropo-Dn6 v nasprotju s pričakovanji nismo opazili vijačnih struktur. Para Tropo-Cn12/Tropo-Dn12 in Tropo-Cn14/Tropo-Dn14 sta dala boljše rezultate. Z merjenjem temperaturne stabilnosti sekundarnih vijačnih struktur smo ugotovili, da je pri paru Tropo-Cn12/Tropo-Dn12 večja razlika med Tm posameznega polipeptida in Tm para. Glede na rezultate smo se zato odločili, da bomo nadaljnjo optimizacijo heterodimernih obvitih vijačnic na osnovi tropomiozina nadaljevali na podlagi Tropo-Cn12/Tropo-Dn12.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [E. Mežnaršič], 2019
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 4825713

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...