VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
-
PlaToLoCo : the first web meta-server for visualization and annotation of low complexity regions in proteinsJarnot, Patryk ...Low complexity regions (LCRs) in protein sequences are characterized by a less diverse amino acid composition compared to typically observed sequence diversity. Recent studies have shown that LCRs ... may co-occur with intrinsically disordered regions, are highly conserved in many organisms, and often play important roles in protein functions and in diseases. In previous decades, several methods have been developed to identify regions with LCRs or amino acid bias, but most of them as stand-alone applications and currently there is no web-based tool which allows users to explore LCRs in protein sequences with additional functional annotations. We aim to fill this gap by providing PlaToLoCo - PLAtform of TOols for LOw COmplexity-a meta-server that integrates and collects the output of five different state-of-the-art tools for discovering LCRs and provides functional annotations such as domain detection, transmembrane segment prediction, and calculation of amino acid frequencies. In addition, the union or intersection of the results of the search on a query sequence can be obtained. By developing the PlaToLoCo meta-server, we provide the community with a fast and easily accessible tool for the analysis of LCRs with additional information included to aid the interpretation of the results. The PlaToLoCo platform is available at: http://platoloco.aei.polsl.pl/.Vir: Nucleic acids research. - ISSN 0305-1048 (Vol. 48, iss. W1, Jul. 2020, str. W77-W84)Vrsta gradiva - članek, sestavni delLeto - 2020Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 54568195
Avtor
Jarnot, Patryk |
Ziemska-Legiecka, Joanna |
Dobson, Laszlo |
Merski, Matthew |
Mier, Pablo |
Andrade-Navarro, Miguel A. |
Hancock, John M. |
Dosztányi, Zsuzsanna |
Paladin, Lisanna |
Necci, Marco
Teme
beljakovine |
spletni meta-strežnik |
vizualizacija |
proteins |
web meta-server |
visualization
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Jarnot, Patryk | |
Ziemska-Legiecka, Joanna | |
Dobson, Laszlo | |
Merski, Matthew | |
Mier, Pablo | |
Andrade-Navarro, Miguel A. | |
Hancock, John M. | 55087 |
Dosztányi, Zsuzsanna | |
Paladin, Lisanna | |
Necci, Marco |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: