Akademska digitalna zbirka SLovenije - logo
VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Odkrivanje vampnih bakterij z oligonukleotidnimi sondami, in situ hibridizacijo in epifluorescentno mikroskopijo
    Tepšič, Katarina ; Avguštin, Gorazd
    Fluorescentno označene oligonukleotidne sonde smo uporabili za specifično odkrivanje vampnih bakterij v in situ hibridizacijskih poskusih. Vzorec vampne vsebine iz črno bele krave frizijske pasme smo ... obdelali s specifičnimi sondami za filogenetsko skupino Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides (BACPRE) in vrste Prevotella bryantii (PBB14) ter P. ruminicola (PR23). Oligonukleotidne sonde smo označili z fluorescin izotiociantom (FITC) ali tetrametilrodamin izotiocianatom (TRITC). Bakterijske celice iz vzorca smo po separaciji, fiksaciji in dehidraciji obdelali s hibridizacijsko raztopino pri 46 stopinj C in po spiranju signale opazovali z epifluorescentnim mikroskopom. Ker je številčna ocena specifičnih mikrobnih populacij z epifluorescentnim mikroskopom brez ustreznega, računalniško podprtega sistema za avtomatsko kvantifikacijo, izjemno zahtevna in v praksi neuporabna metoda, smo začeli uvajati kvantitativno metodo za določanje števila tarčnih mikroorganizmov v vzorcu na osnovi modifikacije verižne reakcije s polimerazo (PCR). Ta metoda naj bi v kombinaciji z in situ hibridizacijo in epifluorescentno mikroskopijo omogočala hitro in rutinsko odkrivanje in spremljanje dinamike posameznih mikrobnih populacij v naravnih ekosistemih, kot je to vamp prežvekovalcev.
    Vrsta gradiva - prispevek na konferenci
    Leto - 1998
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 685960