Akademska digitalna zbirka SLovenije - logo
BF, Oddelek za zootehniko, Ljubljana (BFZOO)
  • Variabilnost rRNA operonov v vampnih vrstah iz rodu Prevotella
    Peterka, Matjaž ; Avguštin, Gorazd
    Analizirali smo število operonov ribosomskih RNA in variabilnost v nukleotidnem zaporedju med posameznimi kopijami genov za 16SrRNA pri vampnih bakterijskih vrstah iz rodu Prevotella. Genomsko DNA ... smo izolirali in razrezali s petimi restrikcijskimi endonukleazami, dobljene fragmente elektroforetsko ločili na agaroznem gelu in prenesli na najlonsko membrano. Z verižno reakcijo s polimerazo DNA (PCR) smo namnožili gene za 16S in 23S podenoto ribosomske RNA, jih označili z digoksigeninom in uporabili kot sonde pri hibridizaciji. Glede na število signalov lahko sklepamo, da imajo sevi vrste P. albensis 4 ali 5 rNA operonov, sevi vrste P. brevis 4 rRNA operone, sevi vrste P. bryantii 6 ali 7 rRNA operonov in sevi vrste P. ruminicola 4 rRNA operone z izjemo enega seva, ki ima 6 ali 7 rRNA operonov. DNA fragmente,ki so odgovarjali 16S rRNA hibridizacijskem signalom tipskih sevov omenjenih vrst, smo izolirali iz agaroznega gela, jih uporabili kot matrico v PCR reakciji. Tako namnožene gene za 16S rRNA smo uporabili kot matrico pri sekvenciranju 489 bp dolge regije na začetku teh genov. Nukleotidna zaporedja smo obdelali s programi v računalniških paketih Clustal in Phylip. Razlike medposameznimi geni so segale od 1,43 % do 10,02 %.
    Vrsta gradiva - prispevek na konferenci
    Leto - 1998
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 684168