Verifikacija komercialnega sestava za hitro detekcijo variant omikron SARS-Cov-2 = Verification of a commercial kit for rapid omicron SARS-Cov-2 variants detection : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicina
Halilović, Edin, farmacevt
Od odkritja leta 2019 pa do konca leta 2021 so pri povzročitelju bolezni COVID-19, virusu SARS-CoV-2, potrdili na tisoče različnih mutacij, zaradi katerih so nastale njegove različice, ki vzbujajo ...skrb zaradi pospešenega širjenja in potencialno hujše klinične slike same bolezni. Ena zadnjih tovrstnih, nevarnih različic je različica omikron. Vsake različice SARS-CoV-2 seveda ne moremo zaznati s standardno metodo RT-PCR, sekvenciranje virusne RNA pa je drago in časovno precej zahtevno. Cilj magistrskega dela je bila verifikacija komercialnega sestava NovaplexTM SARS-CoV-2 Variants VII Assay in njegova primerjava z referenčno metodo sekvenciranja, za zaznavanje različic SARS-CoV-2, z namenom hitrejšega ugotavljanja širjenja posameznih različic virusa v populaciji. V raziskavi smo uporabili vzorce RNA 43 bolnikov z, v obdobju od 1. 12. 2021 do 30. 1. 2022 ugotovljeno prisotnostjo virusa SARS-CoV-2, in sicer z metodo RT-PCR v obliki komercialnega sestava TaqPath␢ COVID-19 CE-IVD RT-PCR. Izbrane vzorce smo analizirali s testom NovaplexTM SARS-CoV-2 Variants VII, obenem pa smo jih poslali še na sekvenciranje na Hrvaški zavod za javno zdravstvo. Pričakovali smo visoko stopnjo primerljivosti rezultatov (> 95 %), pridobljenih s testiranim reagenčnim kompletom in z referenčno metodo, glede na to, da je prvi namenjen prav zaznavanju različic omikrona. Poleg tega smo preverili tudi zanesljivost kompleta TaqPath␢ COVID-19 CE-IVD RT-PCR kot presejalne metode za odkrivanje različic omikron BA.1 in BA.2, saj je ta namenjen zaznavi gena S virusa SARS-CoV-2, ki pa pri varianti BA.1, zaradi mutacije, ni več sposoben pomnoževanja. S testiranjem smo dejansko ugotovili 95-odstotno primerljivost rezultatov, pridobljenih s testiranim reagenčnim kompletom in z referenčno metodo sekvenciranja. Prav tako smo potrdili, da lahko komercialni komplet TaqPath␢ služi kot presejalni test za različico omikron BA.1, za katero je značilen izpad pomnoževanja gena S, obenem pa ugotovili, da ni uporaben za presejalno testiranje na prisotnost različice omikron BA.2 in njene podvariante BA.2.3, saj se pri njiju obeh v tem reagenčnem kompletu poteče podvajanje gena S.
Vrsta gradiva - magistrsko delo
; neleposlovje za odrasle
Založništvo in izdelava - Ljubljana : [E. Halilović], 2023
Bibliografsko gradivo je bilo uspešno dodano na polico.
Dodajanje bibliografskega gradiva na polico ni uspelo.
Gradivo je že na polici.
Trajna povezava
URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto
Faktor vpliva
Izdaja
Kategorija
Razvrstitev
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Izberite knjižnično izkaznico:
Baze podatkov,
v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov
Področje
Leto
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev
Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Citiranje
Funkcionalnost trenutno ni na voljo. Prosimo, poskusite kasneje.
