Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana (NUK)
-
Binding-sites prediction assisting protein-protein dockingKonc, Janez ...Most biological actions of proteins, including their ability to interact with one another, involve some specific parts of their three-dimensional structure,called binding sites. These have evolved ... for their ability to bind other molecules effectively and are often conserved in different proteins. Identifying protein-protein binding sites in a protein that is known to interact with other proteins can provide important clues to the function of the protein and can also be used in proteinprotein docking studies to reduce the search space explored by docking algorithms. We have developed an algorithm for structural similarity search in a database of non-redundant protein structures to find conserved binding regions on proteins involved in protein-protein interactions. We have used this algorithm to find conserved regions on a protein surface. The structurally conserved residues found were labeled as a protein-protein binding site, which allowed us to tune the AutoDock docking algorithm to predict the native protein complex structure from unbound protein structures. The conservation of protein structures that correctly predicted protein-protein binding site was used in AutoDock program to improve protein-protein docking. A web application based on our method is available at http://probis.cmm.ki.si.Vir: Acta chimica slovenica. - ISSN 1318-0207 (Vol. 58, no. 3, 2011, str. 396-401)Vrsta gradiva - članek, sestavni delLeto - 2011Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 4787738
Avtor
Konc, Janez |
Trykowska Konc, Joanna |
Penca, Matej |
Janežič, Dušanka, 1952-
Teme
binding-sites |
prediction |
protein structure |
docking |
structural similarity |
probis |
biokemija |
proteini |
proteinsko sidranje |
struktura
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Konc, Janez | 25435 |
Trykowska Konc, Joanna | 34881 |
Penca, Matej | 03455 |
Janežič, Dušanka, 1952- | 06734 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema:
Naročanje gradiva za izposojo v čitalnice
Naročanje kopij člankov
Urnik dostave gradiva z oznako DS v signaturi