The present paper reports the role of water in plant pathology as possible stress factor and vector of pathogens. The latter aspect is considered in a scenario of general risk of introduction and ...spread of invasive plant pathogens. In addition to peculiar epidemiology aspects, the possible diagnostic methodologies and control methods are considered. The role of water as stress factor is analysed in a general frame of climatic global changes that could enhance the risk of severe drought events. Within this frame, some model pathosystems are described where water plays a role as co-factor or inciting factor in disease development
Nella presente trattazione viene affrontato il ruolo dell' acqua nell'ambito della patologia vegetale, con particolare riguardo alla sua funzione come possibile co-fattore di stress e vettore di agenti di malattia. In particolare, quest'ultimo aspetto viene trattato in un contesto generale di rischio di diffusione di specie invasive in sistemi agro-forestali. Oltre agli aspetti prettamente epidemiologici, vengono prese in considerazione le possibili metodologie diagnostiche e le strategie di contenimento. L'azione dell'acqua come co-fattore di stress è analizzata all'interno di uno scenario di cambiamenti climatici globali, che aumentano gradualmente il rischio di eventi climatici estremi come la siccità. In tale ambito vengono descritti alcuni patosistemi modello in cui l'acqua gioca un ruolo come fattore di modulazione dell'intensità dell'attacco o come vero e proprio fattore scatenante
Conventional and Scorpion primers were designed from the ITS regions to identify Rosellinia necatrix, Phytophthora nicotianae and P. citrophthora and from the IGS regions to identify Verticillium ...dahliae and V. albo-atrum. Specificity of primers and probes was assessed using genomic DNA from a large number of fungi from several hosts and by means of BLAST analyses, to exclude the presence of similar sequences in other micro-organisms among available DNA databases (GenBank). Simple and rapid procedures for DNA extraction from naturally infected matrices (soils, roots, bark and/or woody tissues) were utilised to yield DNA of a purity and quality suitable for PCR assays. Combining these protocols with a double amplification (nested Scorpion-PCR), the real-time detection of these pathogens was possible from naturally infested soils and from infected citrus roots (P. nicotianae and P. citrophthora), from the roots and bark of stone fruits and olive (R. necatrix) and from olive branches (V. dahliae). For target pathogens, the limit of detection was 1 pg micronlE-1 in Scorpion-PCR and 1 fg micronlE-1 in nested Scorpion-PCR. High and significant correlations between pathogen propagule concentrations and real-time PCR cycle thresholds were obtained. Moreover, specific tests with R. necatrix seem to indicate that its DNA is quite rapidly degraded in the soil, excluding the risk of false positives due to the presence of dead cells
Sono stati messi a punto primer convenzionali e Scorpion dalle regioni ITS per identificare Rosellinia necatrix, Phytophthora nicotianae e P. citrophthora e dalle regioni IGS per Verticillium dahliae e V. albo-atrum. La specificità dei primer e delle sonde è stata accertata utilizzando DNA genomico da un vasto numero di funghi derivanti da numerosi ospiti e mediante analisi BLAST, per escludere la presenza di sequenze simili in altri microorganismi in basi di dati di DNA (GenBank). Sono state utilizzate procedure semplici e rapide per l´estrazione del DNA da matrici infette naturalmente (suoli, radici, corteccia e/o tessuti lignificati), per ottenere DNA di purezza e qualità adatte per saggi PCR. Combinando questi protocolli con una doppia amplificazione (nested Scorpion-PCR), è stata possibile l´individuazione in tempo reale di questi patogeni da terreni infestati naturalmente e da radici infette di agrumi (P. nicotianae e P. citrophthora), da radici e cortecce di prunoidee e di olivo (R. necatrix) e da rami di olivo (V. dahliae). Per i patogeni target, il limite di individuazione è risultato di 1 pg micronlE-1 nella Scorpion-PCR e di 1 fg micronlE-1 nella nested Scorpion-PCR. Sono state ottenute correlazioni elevate e significative fra le concentrazioni di propaguli dei patogeni e soglie dei cicli di PCR in tempo reale. Inoltre, test specifici con R. necatrix sembrano indicare che il suo DNA sia degradato molto rapidamente nel suolo, escludendo il rischio di falsi positivi dovuti alla presenza di cellule morte.
Esca (black measles) of grapevine has long been known to occur wherever grapes are grown. Phaeomoniella chlamydospora and two species of Phaeoacremonium, Pm. inflatipes and Pm. aleophilum, have been ...associated with esca and Petri grapevine decline in major production regions of California. Though present in symptomatic grapevines and capable of causing foliar symptoms of esca, Phaeomoniella chlamydospora does not cause the typical symptoms on fruit. However, trapping studies showed that spores of Pa. chlamydospora , Pm. inflatipes and Pm. aleophilum were captured throughout the year in vineyards ranging from the North California coast to the Southern San Joaquin Valley. They can be considered airborne fungi capable of being water-splashed by pruning or other wounds during part of their biological cycle. Trapping of spores coincided with rainfall events for Pa. chlamydospora and Pm. inflatipes and, to a lesser degree, for Pm. aleophilum. However, this last species was trapped during periods of time when rainfall did not occur and was trapped longer in the Summer
E' noto da tempo che il mal dell'esca della vite si verifica in tutte le zone di coltivazione di questa specie. Phaeomoniella chlamydospora e due specie di Phaeoacremonium, Pm. inflatipes e Pm. aleophilum, sono state associate con il mal dell'esca e il deperimento della vite di Petri nelle principali aree viticole della California. Sebbene sia presente nelle piante di vite sintomatiche e capace di causare sintomi fogliari del mal dell'esca, Phaeomoniella chlamydospora non causa i sintomi tipici sul frutto. Comunque, studi effettuati con trappole hanno dimostrato che le spore di Pa. chlamydospora, Pm. inflatipes e Pm. aleophilum venivano catturate nel corso dell'anno nei vigneti dalla California del Nord alla Valle di San Joaquin. Essi possono essere considerati funghi trasportati dall'aria, capaci di essere diffusi tramite l'acqua da ferite da potatura o di altra origine durante parte del loro ciclo biologico. L'intrappolamento delle spore coincideva con gli eventi piovosi per Pa. chlamydospora e Pm. inflatipes e, in minor grado, per Pm. aleophilum. Comunque, quest'ultima specie veniva intrappolata durante periodi di tempo senza pioggia ed era intrappolata piu' a lungo in estate
Karbapenem rezistentne bakterije (CRB) su vodeći uzročnici emergentnih bolničkih infekcija diljem svijeta. CRB su nađene u bolničkim otpadnim vodama, kojima se šire putem skupne kanalizacije u ...okoliš. Prisutnost CRB u okolišu predstavlja javnozdravstveni rizik. U ovom radu ispitana je učinkovitost elektrokemijske dezinfekcije vode za uklanjanje emergentnih CRB. Istosmjerna električna struja (DC, eng. direct current) niske jakosti pokazala je baktericidni učinak prema čistoj kulturi CRB Acinetobacter baumannii u fiziološkoj otopini. Primjenom DC niske jakosti nakon reakcijskog vremena od 300 s uklonjeno je 25 % CRB iz sirove bolničke vode, pri čemu se značajno smanjila koncentracija amonijeva iona (NH4+), pH vrijednost vode ostala neutralna, a temperature vode nije prešla 36℃. Dezinfekcija bolničkih voda elektrokemijskim procesima čini se obećavajućom alternativom nedovoljno učinkovitoj kemijskoj dezinfekciji vode u svrhu sprečavanja širenja CRB u okoliš.
Brittle leaf disease of date palms, known in Southern Tunisia since the 1960s, has assumed epidemic proportions from 1986 on. The symptoms are associated with manganese deficiency and the presence of ...a small double stranded RNA of host origin. Even though no pathogen has yet been found, some observations do not fit a purely abiotic cause of the disease. In particular, affected trees seem to cluster into foci and mineral analyses show no significant differences between the soils of affected and unaffected trees. Further work is required to understand the aetiology of the disease
La malattia delle foglie fragili delle palme da datteri, nota in Tunisia Meridionale fin dagli anni '60, ha assunto proporzioni epidemiche dal 1986. I sintomi sono associati alla carenza di manganese e alla presenza di un piccolo RNA a doppia elica originato dall'ospite. Sebbene non sia ancora stato ritrovato un agente patogeno, alcune osservazioni non concordano con una causa puramente abiotica della malattia. In particolare, le piante colpite sembrano raggrupparsi in focolai e le analisi dei minerali non evidenziano differenze significative fra i terreni delle piante colpite e non colpite. E' necessario un ulteriore lavoro di ricerca per comprendere l'eziologia della malattia
Bakterija Acinetobacter baumannii u današnje je vrijeme vodeći uzročnik bolničkih infekcija, ponajprije zbog brzoga razvoja otpornosti te bakterije na antimikrobne lijekove. Klinički značajni A. ...baumannii izvan bolničkoga okružja, kao što su prirodna tla pod utjecajem ljudskoga otpada, javnozdravstveni su rizik za ljude i životinje. Cilj ovoga rada bio je istražiti potencijal zeolita modificiranih metalima za uklanjanje vijabilnih A. baumannii iz umjetno zagađenih prirodnih tala. Izolat A. baumannii u vlažnoj blago kiseloj terra rossa (pH 5,40) i blago lužnatom crvenom paleotlu (pH 8,43) podvrgnut je djelovanju prirodnoga zeolitnoga tufa (NZ) te NZ-a modificiranoga bakrom (CuNZ) ili srebrom (AgNZ). U slučaju dodatka 1 wt% NZ-a, A. baumannii je preživio u terra rossa sedam dana, a u crvenom paleotlu čak četiri mjeseca. Dodatak 1 wt% CuNZ-a u tla skratio je preživljavanje A. baumannii na tri dana u terra rossa i 14 dana u crvenom paleotlu. Dodatak samo 0,1 wt% AgNZ-a u tla rezultirao je kompletnim uklanjanjem vijabilnih A. baumannii tijekom jednoga sata kontakta, pri čemu je brojnost ukupnih heterotrofnih bakterija, prirodno prisutnih u tlu, ostala visoka. Čestice AgNZ-a pripremaju se jednostavnom modifikacijom jeftinoga i okolišno prihvatljivoga prirodnoga zeolita. Mala koncentracija (1 g AgNZ-a po 1 kg tla) mogla bi se jednostavno raspršiti po tlu koje je zagađeno bakterijom A. baumannii. Stoga je AgNZ obećavajući materijal za remedijaciju tala zagađenih tom bakterijom koja je otporna na sve dostupne antibiotike.
Glavni bakterijski uzročnici respiratornih
infekcija Streptococcus pneumoniae, betahemolitički
streptokok grupe A (BHS-A), Haemophilus infl uenzae i
Moraxella catarrhalis dugo su bili dobro ...osjetljivi na
antibiotike. Široka upotreba antibiotika dovela je, međutim,
do razvoja mnogih mehanizama rezistencije na razne
antibiotike. U liječenju respiratornih infekcija osobito je
bitan razvoj rezistencije na betalaktamske i makrolidne
antibiotike. U Hrvatskoj 29% pneumokoka pokazuje
umjerenu i 3% visoku rezistenciju na penicilin, dok je na
makrolide rezistentno 27% pneumokoka. BHS-A ne pokazuje
rezistenciju na penicilin, ali rezistencija na makrolide u
Hrvatskoj iznosi 14%. Gotovo svi izolati M. catarrhalis i mnogi
sojevi Haemophilusa infl uenzae (10% u Hrvatskoj) proizvode
beta-laktamaze, što ih čini rezistentnima na amoksicilin, ali
ne i na kombinaciju amoksicilina i inhibitora beta-laktamaza.
In vitro osjetljivost uzročnika na antibiotik primijenjen u
liječenju bitan je povoljni čimbenik u korist domaćina, no
ishod infekcije ovisi i o intrinzičnoj patogenosti uzročnika
te obrambenim snagama domaćina. Farmakokinetika (PK)
i farmakodinamika (PD) antibiotika može znatno utjecati
na djelotvornost in vivo te se PK/PD-parametri sve više
prihvaćaju u određivanju doziranja antibiotika i korekciji
graničnih koncentracija pri testiranju in vitro. Porast
rezistencije na antibiotike među respiratornim patogenima
zasada nije doveo do dramatičnog porasta smrtnosti od
respiratornih infekcija, no smrtni je ishod samo grubi
pokazatelj ishoda infekcije.
Pozadina istraživanja. Mikrobna kontaminacija je jedan od važnijih uzroka kvarenja hrane i pojave bolesti koje se prenose hranom. Primjenom aktivnih filmova za pakiranje hrane obogaćenih ...antimikrobnim agensima može se poboljšati kakvoća hrane i produljiti njezina valjanost. No, potrošači su sve više zabrinuti zbog moguće toksičnosti mnogih antimikrobnih agensa koji se primjenjuju u tim filmovima, kao što su srebro, bakar, titan i cink.
Eksperimentalni pristup. Svrha je ovoga rada bila izraditi biorazgradive jestive filmove od želatine obogaćene mikrokapsulama antocijana izoliranih iz plavog graška (Clitoria ternatea) kao prirodnih antimikrobnih agensa. Ispitan je utjecaj mikrokapsula s antocijanima na morfologiju, toplinska, mehanička i fizikalno-kemijska svojstva filmova, te njihovu propusnost vodene pare. Također je ispitan učinak dobivenih filmova na patogene mikroorganizme u hrani i zaštitu lako pokvarljivih proizvoda.
Rezultati i zaključci. Rezultati pokazuju da su se fizikalna i mehanička svojstva filmova poboljšala s dodatkom mikrokapsula antocijana, koje su povećale gustoću, vlačnu čvrstoću, Youngov modul elastičnosti i istezljivost filma. Ispitivanjem morfoloških značajki pretražnom elektronskom mikroskopijom utvrđeno je da film obogaćen antocijanima imao homogenu i glatku površinu, za razliku od kontrolnog uzorka. Termogravimetrijskom je analizom potvrđeno blago poboljšanje toplinskih svojstava filmova. Difuzijom u jažicama agara otkriveno je da dobiveni filmovi imaju znatan inhibicijski učinak na širok spektar bakterija. Osim toga, filmovi od želatine s dodatkom mikrokapsula antocijana smanjili su ukupni broj živih stanica mikroorganizama u tofuu tijekom 12 dana skladištenja, u usporedbi s kontrolnim uzorcima.
Novina i znanstveni doprinos. Veća svijest ljudi o važnosti zdrave i sigurne prehrane sa što manjim udjelom sintetičkih konzervansa potakla je potragu za antimikrobnim agensima iz prirodnih izvora koji se mogu upotrijebiti u materijalima za aktivno pakiranje hrane. U ovom je radu razvijen siguran i učinkovit aktivni ambalažni film s dodatkom ekološki prihvatljivog biopolimera, želatinskog filma obogaćenog mikrokapsulama antocijana izoliranih iz plavog graška (Clitoria ternatea) kao prirodnih antimikrobnih agensa. Istraživanje je pokazalo da se ovom metodom mogu poboljšati fizikalna svojstva filma, ali i bitno produljiti vrijeme skladištenja hrane, jer ih dobiveni film štiti od mikrobnog kvarenja.
Polygalacturonase and polymethylgalacturonase activity was detected in 13 strains of Phaeomoniella chlamydospora as well as in filtrates of isolates of some related fungi (Phaeoacremonium aleophilum, ...P. inflatipes, P. rubrigenum). Tests consisted of growth and colorimetric assays on media, designed to evaluate different pectic enzymes. Phaeomoniella isolates on the same medium did not differ greatly in their morphological and cultural characters, but pectinolytic activity differed among isolates
In 13 ceppi di Phaeomoniella chlamydospora e in filtrati di isolati di alcuni funghi collegati (Phaeoacremonium aleophilum, P. inflatipes, P. rubigenum) e' stata rilevata l'attivita' poligalatturonasica e polimetilgalatturonasica. I test consistevano in saggi di crescita e colorimetrici sui substrati, per valutare i diversi enzimi pectici. Gli isolati di Phaeomoniella sul medesimo substrato non differivano notevolmente per quanto riguardava i rispettivi caratteri morfologici e colturali, ma l'attivita' pectinolitica era diversa nell'ambito degli isolati