Univerza na Primorskem Univerzitetna knjižnica - vsi oddelki (UPUK)
-
ProBiS-Fold approach for annotation of human structures from the alphafold database with no corresponding structure in the PDB to discover new druggable binding sitesKonc, Janez ; Janežič, Dušanka, 1952-ProBiS (Protein Binding Sites), a local structure-based comparison algorithm, is used in the new ProBiS-Fold web server to annotate human structures from the AlphaFold database without a ... corresponding structure in the Protein Data Bank (PDB) to discover new druggable binding sites. The ProBiS algorithm is used to compare each query protein structure predicted by the AlphaFold approach with the protein structures from the PDB to identify similarities between known binding sites found in the PDB and yet unknown binding sites in the AlphaFold database. Ligands bound in these identified similar PDB sites are then transferred to each query protein from the AlphaFold database, and binding sites are identified as ligand clusters on an AlphaFold protein. Small molecule binding sites are assigned druggability scores based on the similarity of their ligands to known drugs, allowing them to be ranked according to their perceived and actual potential for drug development. ProBiS-Fold provides interactive and downloadable binding sites for the entire human structural proteome, including more than 3000 new druggable binding sites that have no corresponding structure in the PDB, taking into account AlphaFold’s model quality, to enable protein structure–function relationship studies and pharmaceutical drug discovery research.Vir: Journal of chemical information and modeling. - ISSN 1549-9596 (Vol. 62, iss. 22, Oct. 21, 2022, str. 5821−5829)Vrsta gradiva - članek, sestavni del ; neleposlovje za odrasleLeto - 2022Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 126704899
vir: Journal of chemical information and modeling. - ISSN 1549-9596 (Vol. 62, iss. 22, Oct. 21, 2022, str. 5821−5829)
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Konc, Janez | 25435 |
Janežič, Dušanka, 1952- | 06734 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: