Introducción: el conocimiento y la percepción hacia los medicamentos genéricos son temas que surgen como un factor importante a explorar en los estudiantes de medicina. Objetivo: determinar las diferencias entre los estudiantes de medicina de universidades públicas y privadas sobre la percepción y el uso de las Especialidades Farmacéuticas Genéricas (EFG). Materiales y métodos: se realizó un estudio cuantitativo de tipo observacional, transversal, analítico y comparativo en un universo de 858 estudiantes matriculados durante 2019-2020 en cinco escuelas de medicina del estado mexicano de Tabasco. A través de Google Forms se recolectaron los datos de un formulario auto aplicado con base a un cuestionario previamente validado. Se emplearon estadísticas descriptivas para evaluar las percepciones de los estudiantes y pruebas no paramétricas a través de un modelo de análisis de diferencia de medias para comparar el resultado entre las universidades. Resultados: la percepción de las dimensiones de calidad (Ẋ= 12,51) y eficacia (Ẋ=6,06) muestran una postura indecisa en general. En la fiabilidad (Ẋ=6,99), los alumnos estuvieron de acuerdo. Las dimensiones de preferencia-experiencia (Ẋ=10,649) y la de accesibilidad (x=7,01), colocan a los alumnos en el grupo de indecisos. En la comparación de medias de la escala de percepción de EFG (prueba t de estudent), la universidad pública presentó una media baja (ẋ=24,72), mientras que en el grupo de universidades privadas fue mayor (ẋ=26,06). En cuanto al uso de EFG, la universidad pública presentó una media ẋ=38,22, mientras que el grupo de universidades privadas fue menor (ẋ=36,70). Conclusiones: se requiere incluir en los contenidos curriculares de los futuros profesionales de la medicina, mayor información sobre calidad, seguridad y eficacia de las EFG, lo que contribuirá a elevar el nivel de confianza en su prescripción.