Antecedentes. Actualmente el uso del animal de laboratorio en educación está siendo eliminado a nivel mundial y se buscan otras estrategias que permitan sustituirlo, pues no hay evidencia de que los estudiantes formados con métodos alternativos sean menos calificados. Objetivo. Contrastar la opinión de los estudiantes de farmacología, carrera de Farmacia Universidad Nacional de Colombia, sobre la implementación de un software interactivo en comparación con el montaje de órgano aislado. Material y métodos. Se comparó un recurso pedagógico usando animales en el laboratorio, con otro recurso basado en un software interactivo, para la práctica de "órgano aislado en intestino de roedor" por medio de la aplicación de una encuesta a estudiantes de séptimo semestre. Resultados. La opinión de los estudiantes, en una escala de uno a cinco, es que existen ventajas del montaje de órgano aislado sobre el software interactivo (p menor que 0,05) en cuanto al aporte de información (mediana 5:4 respectivamente), la integración de conocimientos (mediana 5:4) y la interpretación de datos inesperados (mediana 4:3). En cuanto a la claridad de la información obtenida la apreciación de los estudiantes muestra que no existen diferencias entre las dos alternativas (mediana 4). La utilización del animal involucra un costo ético (67%) que no se da con el empleo del software (27%). Finalmente es muy alta la aceptación del software interactivo como una ayuda eficaz para el aprendizaje de la farmacología (77%) y es notorio el interés de los estudiantes en que éstas alternativas sean implementadas en otras asignaturas (79%). Conclusión. Los estudiantes opinan que, aun cuando pueden perderse algunos componentes de la práctica con la implementación del software interactivo (conocimiento del montaje real, enfrentamiento a las dificultades propias de la experimentación con seres vivos y acercamiento al proceso dinámico de la vida), no hay diferencias relevantes entre los dos recursos de enseñanza.