La cuenca Salí-Dulce es una de las principales del Noroeste de Argentina y en su recorrido se ve afectada debido a la incorporación de sustancias contaminantes. En los ecosistemas acuáticos continentales las diatomeas constituyen un grupo destacado. Su biología y taxonomía son adecuadas para su uso en el biomonitoreo. El objetivo fue caracterizar la dinámica y la composición de las taxocenosis de diatomeas y su relación con variables ambientales en los arroyos Mista y Calimayo, pertenecientes a la cuenca del río Salí-Dulce (Tucumán-Argentina). Para esto se seleccionaron tres sitios en cada arroyo y se tomaron datos de variables ambientales y biológicas según metodologías convencionales. La calidad del agua fue variable según el aporte de contaminantes y la estacionalidad climática. El ensamble de diatomeas resultó ser una taxocenosis bioindicadora sensible a las características ambientales de los arroyos. En este trabajo se registraron 61 especies de las cuales 11 serían buenas indicadoras del estado de contaminación. El uso de dos índices bióticos permitió afirmar que el Índice de Diatomeas Pampeano modificado según datos propios, resultó más sensible y eficaz en la determinación de la calidad del agua, por lo que se podría considerar como una herramienta diagnóstica, de seguimiento de la calidad del agua y de planificación que serviría para brindar información válida y de fácil aplicación en cuencas del Noroeste de Argentina. The Salí-Dulce basin is one of the main in the Northwest of Argentina and is affected by significant ecological changes due to the presence of polluting substances along its way. Diatoms are a prominent algal group in aquatic ecosystems. Their biology and taxonomy are suitable for their use in biomonitoring based on their specific responses to environmental changes. The objective of this study was to characterize the dynamic and composition of the taxocenosis of diatoms and their relationship with environmental variables in the Mista and Calimayo streams, belonging to the Salí-Dulce river basin (Tucumán-Argentina). For this, three sites were selected in each stream, and data on environmental and biological variables were collected according to conventional methodologies. Water quality was variable depending on the presence of pollutants and climatic seasonality. The diatom assemblage resulted as a sensitive taxocenosis bioindicator of the stream status. In this work, a total of 61 species were recorded, of which 11 could be good indicators for stream contamination. The use of two biotic indices makes it possible to affirm that the Pampean Diatom Index, modified on the basis of our data, resulted to be more sensitive and effective in determining water quality, which is why it could be considered as a tool for diagnosis, water quality monitoring and water planning that could provide valid information of easy application in basins of the Northwest of Argentina.