Los isotiocianatos son compuestos naturales con potente actividad antifúngica producidos por Brassicas como parte de su sistema de defensa. Estos compuestos representan una alternativa a la utilización de compuestos químicos para el control de infecciones fúngicas en productos agrícolas. El objetivo de la revisión fue analizar los estudios publicados acerca de los mecanismos moleculares de la respuesta de hongos al efecto tóxico de los isotiocianatos. Los estudios en Alternaria brassicicola demuestran la inducción de genes cuyos productos cumplen funciones en estrés oxidativo (citocromo P450, tioredoxinas y oxidoreductasas), así como en la excreción de isotiocianatos (glutatión-S-transferasas y transportadores ABC). El hongo A. brassicicola es un patógeno especializado en Brassicas, mientras que Alternaria alternata es un patógeno generalista. Sin embargo, en A. alternata también se reportó la inducción de un gen codificando a un transportador ABC. En base a los datos de la revisión se puede concluir que el mecanismo de respuesta a isotiocianatos en hongos incluye la formación de un conjugado isotiocianato-glutatión que es excretado mediante un transportador ABC. Se sugiere que la utilización de isotiocianatos en combinación con inhibidores de transportadores ABC, podría evitar la resistencia fúngica y constituiría un tratamiento amigable con el ambiente y la salud humana.