ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
-
Računalniška analiza encima MurA in njegovih zaviralcev z vidika načrtovanja novih protibakterijskih učinkovin = Computational analysis of the MurA enzyme and its inhibitors from the perspective of antibacterial agents design : enoviti magistrski študijski program Farmacija : Uniform Master's Study Programme PharmacyFazlić, MerimaAntibiotiki se uporabljajo približno 60 let in lahko zdravijo praktično vse danes poznane okužbe. Žal njihovo uporabo spremlja pojav odpornosti in posledično živimo v času, ko so bakterije razvile ... odpornost na večino antibiotikov. Pri bakterijah je celična stena tista, ki predstavlja ključni strukturni element in tako idealno tarčo pri odkrivanju in razvoju novih antibiotikov. S tem namenom smo se odločili za poseg v sintezo peptidoglikana, saj je le-ta prisoten v prokariontskih celicah in tako omogoča optimalno selektivno ciljanje mikrobnih vitalnih poti. Osredotočili smo se na encim MurA, ki katalizira prvi korak v biosintezi peptidoglikana tako grampozitivnih kot tudi gramnegativnih bakterijah. Pri izdelavi magistrske naloge smo uporabljali različna bioinformacijska orodja, s katerimi smo podrobneje analizirali encim. V prvem delu smo preverjali, ali je encim MurA esencialen za rast, razvoj in preživetje večine bakterij. Temu je sledilo preučevanje evolucijsko ohranjenih aminokislin in identifikacija vezavnih mest, s pomočjo katerega smo določili ključne aminokisline, pomembne za uspešno molekulsko sidranje spojin v aktivno mesto in razvoj potencialne protimikrobne učinkovine. V zadnjem delu smo preverili podatke o potencialnih zaviralcih encima in ovrednotili njihove fizikalno-kemijske lastnosti, lipofilnost, topnost v vodi, farmakokinetične lastnosti, podobnost z učinkovinami ter farmacevtsko-kemijske lastnosti. Pridobljene podatke smo z uporabo različnih programov tudi vizualizirali. Izkazalo se je, da je esencialnost gena MurA dokazana v enaindvajsetih različnih organizmih. S presekom aminokislin z najvišjim odstotkom evolucijske ohranjenosti in aminokislin z najvišjim odstotkom interakcij preko vodikovih vezi, smo kot končni rezultat dobili deset ključnih aminokislin: Lys-22, Asn-23, Asp-49, Arg-91, Arg-120, Glu-188, Thr-304, Asp-305, Arg-331, Arg-397. S pomočjo molekulskih deskriptorjev smo nato ovrednotili osemindvajset znanih zaviralcev encima MurA in naredili izbor treh spojin, ki izkazujejo najboljše lastnosti in so zato najbolj perspektivne za nadaljnji razvoj.Type of material - master's thesis ; adult, seriousPublication and manufacture - Ljubljana : [M. Fazlić], 2021Language - slovenianCOBISS.SI-ID - 58501635
Author
Fazlić, Merima
Other authors
Frlan, Rok
Topics
Antibiotiki |
Bakterijska rezistenca |
MurA |
protibakterijske učinkovine |
bioinformacijska orodja |
evolucijska ohranjenost |
esencialnost |
zaviralci
Library/institution |
City | Acronym | For loan | Other holdings |
---|---|---|---|---|
Faculty of Pharmacy, Ljubljana | Ljubljana | FFALJ |
reading room 1 cop.
|
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
If the library membership card is not in the list,
add a new one.
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Fazlić, Merima | |
Frlan, Rok | 26512 |
Source: Personal bibliographies
and: SICRIS
Select pickup location:
Material pickup by post
Delivery address:
Address is missing from the member's data.
The address retrieval service is currently unavailable, please try again.
By clicking the "OK" button, you will confirm the pickup location selected above and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the above pickup location and delivery address, and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the address selected above and complete the reservation process.
Notification
Automatic login and reservation service currently not available. You can reserve the material on the Biblos portal or try again here later.
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Reservation in progress
Please wait a moment.
Reservation was successful.
Reservation failed.
Reservation...
Membership card:
Pickup location: