Določanje topnosti in termodinamskih parametrov vezave giraznih inhibitorjev = Determination of solubility and thermodynamic binding parameters of gyrase inhibitors : magistrska naloga : enoviti magistrski študij farmacija
Šimec, Domen
Spojina vodnica je spojina, ki ima ustrezno farmakološko aktivnost in je osnova za nadaljnji razvoj zdravilne učinkovine. Iskanje spojin vodnic novih tarč v začetni fazi poteka z metodami ...visokozmogljivega rešetanja, v kasnejših fazah pa se jakost vezave potrdi z biofizikalnimi metodami, med drugim z metodo izotermne titracijske kalorimetrije. Vzporedno s proučevanjem jakosti vezave je pri iskanju in optimizaciji spojine treba proučiti fizikalno-kemijske lastnosti spojin. Eden od osnovnih parametrov je topnost spojine, ki ima velik vpliv na ostale parametre. Razvoj novih protibakterijskih učinkovin je zaradi mutacij bakterij nujno potreben. Pomembna tarča pri protibakterijskem delovanju je tudi encim giraza iz skupine topoizomeraz, ki katalizirajo topološke spremembe DNA bakterij. Tetramer sestavljata 2 enoti giraze A in 2 enoti giraze B. Zaviralcem giraze B smo določili kinetično in termodinamsko topnost. Za ugotavljanje kinetične topnosti smo raztopljeno preiskovano spojino v dimetilsulfoksidu zmešali s fosfatnim pufrom, nastalo suspenzijo pri 25 ␃ stresali 24 ur, centrifugirali in supernatantu določili koncentracijo. Pri termodinamski topnosti pa smo preiskovano snov v presežku raztapljali s fosfatnim pufrom, dobljeno suspenzijo zopet stresali 24 ur pri 25 ␃, po centrifugiranju pa supernatantu določili koncentracijo. Koncentracije smo določili z uporabo tekočinske kromatografije visoke in ultra visoke ločljivosti. Zelo slaba termodinamska in kinetična topnost (manj kot 10 μM) vseh zaviralcev sta posledica vsebujočih lipofilnih skupin, kot so: pirol, klor, brom, metil, benziloksi in piridin. Visoka lipofilnost se kaže z daljšim retencijskim časom, večjim retencijskim faktorjem in večjim izračunanim logaritmom porazdelitvenega koeficienta (nad 2,71). Z uvajanjem bolj hidrofilnih skupin, kot so sečna kislina, oksalna kislina in acetamid, lahko zmanjšamo lipofilnost in topnost nekoliko povečamo, vendar premalo. V drugem delu magistrske naloge smo z izotermno titracijsko kalorimetrijo naredili testne titracije kalcijevega klorida z etilendiamintetraocetno kislino in se prepričali v ustrezno delovanje aparature. Kasneje smo s spojinama IVN-36 in KOB-23 izvedli titracije z girazo B. Pri proučevanih koncentracijah ni prišlo do merljivih sprememb entalpije. Sklepamo lahko, da je vezava IVN-36 in KOB-23 na girazo B predvsem entropijsko vodena. Vezava takšnih spojin je pogosto zelo nespecifična in ima in vivo zaradi vezave na plazemske proteine in druge tarče manjšo učinkovitost in več neželenih učinkov. Vsi proučevani zaviralci imajo slabo topnost ter veliko lipofilnost in so zato močno dovzetni za nespecifično vezavo. Proučevani zaviralci torej niso dobre spojine vodnice.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [D. Šimec], 2022
Knjižnica emšf 0000000544 ŠIMEC DOMEN Določanje 0000001065 IN: 0017215
Knjižnica emšf 544 ŠIMEC DOMEN Določanje 1065 IN: 0017215
available - reading room
Shelf entry
Adding material to shelf was successful.
Adding material to shelf failed.
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
