Ocena interakcij med jedrnimi receptorji in flavonoidi ter izoflavonoidi z metodo in silico = In sillico assessment of flavonoid and isoflavonoid interaction with nuclear receptors
Cerar, Anita, farmacevtka
V zadnjih letih je vedno bolj v ospredju raziskovanje vpliva potencialnih kemičnih motilcev endokrinega sistema (KMES) na delovanje endokrinega sistema. Škodljivi učinki KMES pa predstavljajo tudi ...velik javnozdravstveni problem. Znanstveniki in regulatorni organi se trudijo vzpostaviti testne sisteme, s katerimi bi hitro in zanesljivo lahko preverili ali določena snov deluje kot KMES. V ospredju znanstevnih raziskav so predvsem KMES sintetičnega izvora, mi pa smo se osredotočili na učinke v naravi prisotnih flavonoidov (FL) in izoflavonoidov (IFL). Smernice, za napovedoanje endokrinih učinkov snovi, ki sta jih junija 2018 predstavili Evropska komisija za kemikalije (ECHA) in Evropska agencija za varnost hrane (EFSA) priporočajo uporabo programskih orodij za preverjanje tovrstne aktivnosti spojin. Med omenjenimi programskimi ordji je tudi program Endocrine Disruptome (ED), ki omogoča napovedovanje interakcij z endokrinimi hormonskimi receptorji. ED omogoča sidranje ene spojine hkrati v aktivna mesta 16 struktur, ki pripadajo 12 različnim humanim jedrnim receptorjem. Pri našem delu smo s pomočjo programa ED izvedli sidranje 43 FL in 40 IFL. Rezultate, ki smo jih pridobili s pomočjo programa ED smo primerjali s podatki o potencialnih interakcijah med spojinami in jedrnimi receptorji iz strokovne literature. ED med izbranimi flavonoidi in izoflavonoidi ni vedno pravilno napovedal vezavo tistih spojin, ki so že biološko ovrednotene, in za katere so podatki v strokovni literaturi dostopni. Za IFL ekvol je napačno napovedal vezavo, za 6 IFL in 4 FL pa vezave ni predvidel. Med izbranimi flavonoidi in izoflavonoidi obstajajo tudi takšni, za katere je program ED napovedal visoko afiniteto vezave vsaj na enega izmed preučevanih receptorjev, za katere do zdaj objavljene znanstvene raziskave teh interakcij še niso opisale. Takšnih je 22 FL in 20 IFL. Med izbranimi flavonoidi in izoflavonoidi pa obstajajo tudi 5 FL in 7 IFL, za katere program ED ni napovedal vezave na nobenega od izbranih jedrih receptorjev. ED je primer metode in silico, ki je enostavna za uporabo, s pomočjo katere sklepamo na afiniteto vezave z JHR. Pomanjkljivost programa ED pa je, da ne upošteva drugih interakcij, ki jih FL in IFL imajo v biološkem sistemu. Zaradi pomanjkanja podatkov iz strokovne literature žal ne moremo statistično ovrednotiti napovedne moči ED za možne interakcije med izbranimi FL in IFL ter izbranimi jedrnimi receptorji. Pri interpretaciji pridobljenih rezultatov pa se moramo tudi zavedati, da je delovanje spojin vključno s potencialnimi kemičnimi endokrinimi motilci in vivo zelo kompleksno, zato težko zgolj z metodo in silico določimo obnašanje spojin v bioloških sistemih.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [A. Cerar], 2020
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
