O uso da matriz por espécies que naturalmente habitam manchas florestais pode ser um instrumento importante para restaurar a conectividade em paisagens fragmentadas. O tipo e a estrutura da matriz são determinantes para esta conectividade, porém, poucos estudos exploram este tema. Neste estudo, nós avaliamos a comunidade de pequenos mamíferos dentro de fragmentos florestais e também dentro de dois tipos de matrizes (plantação de café e pasto). No total foram capturadas 11 espécies de pequenos mamíferos, sendo Akodon montensis, Oligoryzomys nigripes e Calomys cerqueirai as mais abundantes nos fragmentos, plantação de café e pasto, respectivamente. Os resultados mostram que a composição e a estrutura da comunidade nos dois tipos de matrizes foram diferentes daquelas encontradas nos fragmentos, e que a matriz de café possui maior abundância e riqueza de espécies que a matriz de pasto.