VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
-
Disentangling the complexity of low complexity proteinsMier, Pablo ...There are multiple definitions for low complexity regions (LCRs) in protein sequences, with all of them broadly considering LCRs as regions with fewer amino acid types compared to an average ... composition. Following this view, LCRs can also be defined as regions showing composition bias. In this critical review, we focus on the definition of sequence complexity of LCRs and their connection with structure. We present statistics and methodological approaches that measure low complexity (LC) and related sequence properties. Composition bias is often associated with LC and disorder, but repeats, while compositionally biased, might also induce ordered structures. We illustrate this dichotomy, and more generally the overlaps between different properties related to LCRs, using examples. We argue that statistical measures alone cannot capture all structural aspects of LCRs and recommend the combined usage of a variety of predictive tools and measurements. While the methodologies available to study LCRs are already very advanced, we foresee that a more comprehensive annotation of sequences in the databases will enable the improvement of predictions and a better understanding of the evolution and the connection between structure and function of LCRs. This will require the use of standards for the generation and exchange of data describing all aspects of LCRs.Vir: Briefings in bioinformatics. - ISSN 1467-5463 (Vol. 21, iss. 2, Mar. 2020, str.458-472)Vrsta gradiva - članek, sestavni delLeto - 2020Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 54616323
Avtor
Mier, Pablo |
Paladin, Lisanna |
Tamana, Stella |
Petrosian, Sophia |
Hajdu-Soltész, Borbála |
Urbanek, Annika |
Gruca, Aleksandra |
Plewczynski, Dariusz |
Grynberg, Marcin |
Hancock, John M.
Teme
protein sequences |
composition bias |
database |
beljakovinska zaporedja |
kompozicijska pristranskost |
zbirka podatkov
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Mier, Pablo | |
Paladin, Lisanna | |
Tamana, Stella | |
Petrosian, Sophia | |
Hajdu-Soltész, Borbála | |
Urbanek, Annika | |
Gruca, Aleksandra | |
Plewczynski, Dariusz | |
Grynberg, Marcin | |
Hancock, John M. | 55087 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: