NUK - logo
(UL)
  • Molecular identification of the acetic acid bacteria isolated from vinegar and plasmid vector construction for Acetobacter spp. : dissertation thesis = Molekularna identifikacija ocetnokislinskih bakterij izoliranih iz kisa in razvoj plazmidnega vektorja za Acetobacter spp. : doktorska disertacija
    Trček, Janja
    Ocetnokislinske bakterije so proizvodni mikroorganizmi v bioprocesih pridobivanja kisa. V industrijskih bioreaktorjih so prilagojene na ekstremno rastno okolje, zaradi česar sta njihova izolacija in ... gojenje v laboratorijskih razmerah močno ovirana. zato so za identifikacijo takšnih bakterij najprimernejše genotipizacijske metode. V tem delu smo vpeljali za identifikacijo rodov ocetnokislinskih bakterij molekulsko metodo, ki temelji na razlikovanju velikosti produktov PCR medgenskih regij 16S-23S rDNK. Vrste znotraj rodu Acetobacter smo lahko razlikovali na osnovi restrikcijskih vzorcev produktov PCR. Drugi del te naloge je usmerjen v konstrukcijo plazmidnih vektorjev. Kot osnovo za konstrukcijo vektorjev smo uporabili plazmid pJK2-1, izoliran iz A. europaeus JK2. Določili smo njegovo celotno nukleotidno sekvenco (3.0 kb) in v njem pet morebitnih bralnih okvirjev. Trije od njih so imeli >33 % identičnost z zaporedji proteinov Rep, Dinj1 in Dinj2. Plazmidni konstrukt pUCJK2-1 (5.8 kb), sestavljen iz celotnih plazmidovp JK2-1 in pUC18, smo z elektroporacijo uspešno vnesli v E. coli XL1-Blue, A. intermedius JK3 in A. europaeus V3. Vrsto vsakega od sevov Acetobacter, uporabljenega v transformacijskih poskusih, smo potrdili s preiskavo nukleotidnih sekvenc genov za 16S in 23S rRNK in s hibridizacijo DNK-DNK celotne DNK z DNK iz vseh tipskih sevov Acetobacter. Pri vsakem od sevov smo preiskali plazmidni profil in profil RAPD. Rekombinantna plazmida sta bila v vsakem od sevov stabilna do konca eksperimenta, tj. do 220. generacije. Z namenom da bi ponovno aktivirali območje z restrikcijskimi mesti za kloniranje in X-gal selekcijo, smo iz plazmida pUCJK2-1 konstruirali plazmid pJT2 (5.6 kb). Plazmid pJT2 ima številna enojna razpoznavna restrikcijska mesta za kloniranje, ki se nahajajo znotraj gena lacZ', se uspešno replicira v E. coli in Acetobacter ter ima gen za rezistenco proti ampicilinu kot selekcijski marker. Plazmidna vektorja pUCJK2-1 in pJT2 sta prva opisana vektorja, ki dajeta možnost nadaljnjih genetskih raziskav v obeh vrstah. Ugotovili smo tudi, da seva A. europaeus JK2 in V3 v nasprotju s tipskim sevom A. europaeus (DSM 6160) ne potrebujeta ocetne kisline za rast, uspešno pa ju lahko precepljamo med gojiščema z in brez ocetne kisline. Zato sta oba seva primernejša kandidata za genetske študije od tipskega seva A. europaeus.
    Vrsta gradiva - disertacija
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [Biotechnical Faculty] : [J. Trček], 1999
    Jezik - angleški
    COBISS.SI-ID - 2291064

Knjižnica Signatura – lokacija, inventarna št. ... Status izvoda
Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana GS II 507482 glavno skladišče prosto - za čitalnico
BF, Centralna biotehniška knjižnica, Ljubljana Skladišče
DR II 9131
IN: 01999056102
prosto - na dom, čas izposoje: 30 dni
BF, Oddelek za živilstvo, Ljubljana Knjižnica
DD 61 a
IN: 0011675
prosto - na dom, čas izposoje: 1 mes.
BF, Oddelek za živilstvo, Ljubljana Knjižnica
DD 61
IN: 0011674
izposojeno - na dom, rok vrnitve: nedoločen
loading ...
loading ...
loading ...