ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Proučevanje vezave zaviralca bakterijske DNA-giraze in topoizomeraze IV s sidranjem in simulacijami molekulske dinamike = Studying binding modes of a bacterial DNA gyrase and topoisomerase IV inhibitor by docking and molecular dynamics simulations : magistrski študijski program Industrijska farmacija
Zupančič, Tina, farmacevtka
Odpornost bakterij proti protibakterijskim učinkovinam se v zadnjih letih poglablja. V prihodnosti zato pričakujemo vse več smrti zaradi doslej ozdravljivih bolezni, kar je zelo zastrašujoče. Dodatna ...težava je posledica dejstva, da je vlaganje v razvoj novih protibakterijskih učinkovin za farmacevtsko industrijo vse prej kot privlačno, saj je donos takih zdravil v primerjavi z zdravili za dolgotrajno zdravljenje kroničnih bolezni zelo nizek. Pomembno vlogo pri upočasnitvi razvoja odpornosti bakterij proti protibakterijskim učinkovinam imajo nove učinkovine z novimi mehanizmi delovanja. Eden od možnih pristopov je zaviranje bakterijske DNA-giraze in topoizomeraze IV. Ta dva encima imata ključno vlogo pri procesih prepletanja in razpletanja dvojne verige DNA, saj olajšata zvijanje in premikanje te verige, to pa vpliva na replikacijo, transkripcijo in rekombinacijo DNA v bakteriji. Oba encima imata podobno strukturo, zato lahko z isto protibakterijsko učinkovino zaviramo oba encima hkrati. Naš namen je bil proučiti nove zaviralce DNA-giraze in topoizomeraze IV, ki so konjugirani z mimetiki sideroforov, s pomočjo računalniških metod kot sta sidranje in simulacije molekulske dinamike. Ti konjugati z vezavo v ATP-vezavno mesto obeh encimov zavirajo njihovo delovanje, s čimer dosežemo protibakterijsko delovanje. Mimetik siderofora potencialno omogoči večji privzem v bakterijsko celico in na ta način ojača protibakterijsko delovanje. Ker zaviralci DNA-giraze in topoizomeraze IV ob uvedbi mimetika siderofora v strukturo ohranijo močno encimsko zaviralno aktivnost, nas je zanimalo, ali mimetik siderofora tvori dodatne interakcije v vezavnem mestu. Simulacije molekulske dinamike so pokazale, da tako v vezavnem mestu DNA-giraze kot v vezavnem mestu topoizomeraze IV mimetik siderofora tvori dodatne vodikove vezi in π-π interakcije, kar bi lahko prispevalo k močni zaviralni aktivnosti proučevane spojine LMD-266. Rezultati magistrske naloge pomembno prispevajo k nadaljnjemu razvoju potencialnih protibakterijskih učinkovin. Spojina LMD-266 močno zavira DNA-girazo in topoizomerazo IV, ima močno protibakterijsko delovanje, zato je smiseln nadaljnji razvoj spojin tega tipa.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [T. Zupančič], 2023
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
