ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Vrednotenje učinkov himernih molekul za razgradnjo O-GlcNAc transferaze na celično linijo diseminiranega plazmocitoma = Biological evaluation of chimeric degraders of O-GlcNAc transferase on a multiple myeloma cell line : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicina
Simonič, Sara
Encim O-GlcNAc transferaza (OGT) je ključen encim v procesu N-acetilglukozaminacije, kar pomeni, da je vključen tudi v številne celične procese. Njegovo deregulacijo povezujejo s številnimi obolenji, ...zato predstavlja morebitno tarčo kot prijemališče za zdravljenje. Za ta namen potrebujemo učinkovito molekulsko orodje, ki bi nam omogočilo proučevanje vloge OGT. V zadnjih letih v ospredje prihajajo himerne molekule, znane tudi kot molekule PROTAC, ki ne zavirajo delovanja tarčnih proteinov, temveč vodijo v njihovo razgradnjo, saj za svoje delovanje izkoriščajo ubikvitin-proteasomski sistem. V sklopu magistrske naloge smo vrednotili biološki učinek dvanajstih himernih razgrajevalcev encima OGT, sintetiziranih na Katedri za farmacevtsko kemijo (UL FFA). Pri načrtovanju molekul PROTAC so kot ligand za OGT uporabili zaviralec OSMI-4 ter različne ligande za E3 ligaze (VHL, CRBN in IAP). Kot celični model smo uporabili celično linijo MM.1S, saj izraža tako tarčni protein OGT kot tudi vse tri ligaze. V prvem delu smo preverjali morebitni vpliv molekul PROTAC na razgradnjo encima OGT. Z metodo prenosa western smo ovrednotili nivo OGT proteina in ugotovili, da pri koncentraciji 1 µM nobena izmed molekul PROTAC ne povzroči vidne razgradnje encima. Ker so himerni razgrajevalci molekulsko velike spojine, smo v nadaljevanju preverili ali odsotnost učinka ni morebiti posledica slabe celične permeabilnosti. Ugotovili smo, da molekule, osnovane na ligandih za ligazo IAP ter CRBN, prehajajo membrano, saj smo potrdili avtorazgradnjo cIAP-1 ter razgradnjo CRBN neosubstrata IKZF1. Znano je, da zaviranje OGT vodi v kompenzatorne mehanizme, ki povzročijo višji novo encima, zato smo nadalje preverili ali je odsotnost razgradnje OGT posledica povratne zanke. S tem namenom smo v celicah zavrli de novo sintezo proteinov z dodatkom cikloheksimida ter jih nato izpostavili himernemu zaviralcu 12. Ugotovili smo, da PROTAC 12 tudi v prisotnosti cikloheksimida ni povzročil vidne razgradnje OGT. Prav tako smo preverjali morebiten vpliv PROTAC 12 na izločanje izbranih vnetnih dejavnikov. Tudi v tem primeru nismo opazili vidnega vpliva na celični fenotip. Rezultati torej kažejo, da nobena od dvanajstih spojin ne vodi v razgradnjo encima OGT, zato bodo potrebne nadaljnje modifikacije molekul PROTAC ali optimizacije eksperimentalnih modelov, da bi s tem dosegli uspešno razgradnjo encima OGT ter z njimi nato podrobneje raziskali vpliv encima v celični homeostazi.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [S. Simonič], 2024
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
