ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Strukturno podprto načrtovanje novih zaviralcev DNA-giraze B = Structure-based design of novel DNA gyrase B inhibitors
Brvar, Matjaž
DNA-giraza je bakterijski encim iz družine topoizomeraz, ki je vpleten v proces podvajanja verižne molekule bakterijske DNA, imenovane plazmid. Njegova vloga je vpeljava dodatnih negativnih zavojev v ...molekulo. Sestavljen je iz dveh podenot A, na katerih je vezavno mesto za DNA-molekulo, in iz dveh podenot B, na katerih je ATP-vezavno mesto. Ker je giraza prisotna samo v bakterijah, predstavlja z vidika selektivne toksičnosti zelo dobro tarčo za razvoj novih protibakterijskih učinkovin. Na osnovi dosedanjih strukturnih podatkov o vezavi dveh skupin naravnih zaviralcev, kumarinov in ciklotialidinov, smo pripravili različne modele ter s pristopom in silico odkrili tri nove razrede zaviralcev DNA-giraze B. Njihovo aktivnost smo ovrednotili z encimskim testom, ki je temeljil na merjenju fluorescence. Dvema razredoma smo in vitro določili tudi protibakterijsko aktivnost. Na podlagi dobljenih rezultatov smo zadetke ovrednotili z različnimi biofizikalnimi metodami, kot so diferenčna dinamična fluorimetrija (DSF), površinska plazemska resonanca (SPR) in mikrotermoforeza (MST). Na koncu smo s proteinsko kristalografijo določili tudi strukturo kompleksa med proteinom G24, ki predstavlja N-terminalni del podenote B, in najbolj učinkovitim zaviralcem, s čimer smo potrdili ustreznost našega modela za prepoznavanje novih potencialnih zaviralcev bakterijske giraze B z delovanjem na ATP-vezavnomesto. S to raziskavo smo prispevali k odkritju novih zaviralcev bakterijske giraze B iz novih strukturnih razredov ter s tem postavili odlično izhodišče za njihovo optimizacijo do novih protibakterijskih učinkovin,ki jih vsakodnevno potrebujemo za zdravljenje naraščajočega števila okužb.
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
