ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
  • G-kvadrupleksi - štirivijačne strukture DNA [Elektronski vir]
    Marušič, Maja
    Medtem ko je dvojno vijačna DNA danes slavna ne le v svetu znanosti, temveč predstavlja njena struktura navdih za arhitekte in umetnike, preostale strukturne oblike DNA še čakajo na svojih pet minut ... slave. Ena izmed teh struktur je štiriverižna DNA. Zanjo je značilno, da se med seboj povežejo štiri z gvanini bogata DNA zaporedja, med katere so lahko vrinjeni drugi nukleotidi. V splošnem takšno zaporedje zapišemo: Xa Gn Xb Gn Xc Gn Xd Gn Xe , kjer je Gn zaporedje n-tih gvaninov, Xa/b/c/d/e pa poljubno dolgo zaporedje poljubnih nukleotidov. Povezava verig poteka preko parjenja štirih gvaninov z vodikovimi vezmi, pri čemer nastane Gkvartet. Štiriverižno DNA ali G-kvadrupleks sestavlja več eden na drugega naloženih G-kvartetov, za njeno stabilnost pa so potrebni kationi. Medtem ko verigi v dvojno vijačni DNA nadvse dolgočasno vedno potekata v nasprotni smeri, so pri G-kvadrupleksih možne vse kombinacije in sta lahko v nasprotno smer obrnjeni nobena, ena ali dve verigi. Med gvaninske ponovitve vrinjeni nukleotidi tvorijo zanke, ki povezujejo štiri verige med seboj. Usmerjenost verig, dolžina zank, vrsta nukleotidov v zankah in način poteka zank so strukturne lastnosti, zaradi katerih so G-kvadrupleksi kljub enakemu jedru zelo različni med seboj. Sprva se je zdelo, da v živih celicah takšne strukture ne morejo nastati. Toda izkazalo se je, da so v genomih živih bitij območja, kot so promotorji genov in telomerni konci kromosomov, z nenavadno velikim številom gvaninov, ki se lahko zvijejo v G-kvadruplekse. Poleg tega so odkrili proteine, ki vežejo štirivijačno DNA in sodelujejo v procesih translacije, transkripcije in rekombinacije. Vse to kaže, da imajo G-kvadrupleksi vlogo pri izražanju genov, kar želijo raziskovalci izkoristiti z načrtovanjem molekul, ki bi z vezavo na štirivijačno DNA vplivale na izražanje genov. Pri našem delu z jedrsko magnetno resonanco ugotavljamo, kakšne G-kvadruplekse tvorijo zaporedja iz promotorskih regij genov ter določamo njihovo 3D strukturo, kar predstavlja osnovo za načrtovanje vezavnih molekul.
    Source: Zbornik povzetkov [Elektronski vir] (Str. 24)
    Type of material - conference contribution
    Publish date - 2012
    Language - slovenian
    COBISS.SI-ID - 5125658

    Link(s):

    http://biomolekularec.si/zbornik12.pdf

Shelf entry