ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Računalniška analiza encima MurA in njegovih zaviralcev z vidika načrtovanja novih protibakterijskih učinkovin = Computational analysis of the MurA enzyme and its inhibitors from the perspective of antibacterial agents design : enoviti magistrski študijski program Farmacija : Uniform Master's Study Programme Pharmacy
Fazlić, Merima
Antibiotiki se uporabljajo približno 60 let in lahko zdravijo praktično vse danes poznane okužbe. Žal njihovo uporabo spremlja pojav odpornosti in posledično živimo v času, ko so bakterije razvile ...odpornost na večino antibiotikov. Pri bakterijah je celična stena tista, ki predstavlja ključni strukturni element in tako idealno tarčo pri odkrivanju in razvoju novih antibiotikov. S tem namenom smo se odločili za poseg v sintezo peptidoglikana, saj je le-ta prisoten v prokariontskih celicah in tako omogoča optimalno selektivno ciljanje mikrobnih vitalnih poti. Osredotočili smo se na encim MurA, ki katalizira prvi korak v biosintezi peptidoglikana tako grampozitivnih kot tudi gramnegativnih bakterijah. Pri izdelavi magistrske naloge smo uporabljali različna bioinformacijska orodja, s katerimi smo podrobneje analizirali encim. V prvem delu smo preverjali, ali je encim MurA esencialen za rast, razvoj in preživetje večine bakterij. Temu je sledilo preučevanje evolucijsko ohranjenih aminokislin in identifikacija vezavnih mest, s pomočjo katerega smo določili ključne aminokisline, pomembne za uspešno molekulsko sidranje spojin v aktivno mesto in razvoj potencialne protimikrobne učinkovine. V zadnjem delu smo preverili podatke o potencialnih zaviralcih encima in ovrednotili njihove fizikalno-kemijske lastnosti, lipofilnost, topnost v vodi, farmakokinetične lastnosti, podobnost z učinkovinami ter farmacevtsko-kemijske lastnosti. Pridobljene podatke smo z uporabo različnih programov tudi vizualizirali. Izkazalo se je, da je esencialnost gena MurA dokazana v enaindvajsetih različnih organizmih. S presekom aminokislin z najvišjim odstotkom evolucijske ohranjenosti in aminokislin z najvišjim odstotkom interakcij preko vodikovih vezi, smo kot končni rezultat dobili deset ključnih aminokislin: Lys-22, Asn-23, Asp-49, Arg-91, Arg-120, Glu-188, Thr-304, Asp-305, Arg-331, Arg-397. S pomočjo molekulskih deskriptorjev smo nato ovrednotili osemindvajset znanih zaviralcev encima MurA in naredili izbor treh spojin, ki izkazujejo najboljše lastnosti in so zato najbolj perspektivne za nadaljnji razvoj.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [M. Fazlić], 2021
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
