ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
13.
Vrednotenje uporabnosti metod in silico pri napovedovanju nevrotoksičnosti, razvojne nevrotoksičnosti in teratogenosti izbranih topil = Evaluation of in silico tools used for prediction of neurotoxicity, developmental neurotoxicity and teratogenicity of selected solvents : enovit magistrski program farmacija
Harinski, Tjaša
Topilom smo ljudje vsak dan zelo izpostavljeni. Pomembno je, da se zavedamo, da ima vsako topilo, tako kot druge snovi, potencialne toksične učinke ne samo na ljudi, ampak tudi na ostali živi svet ...ter na okolje okoli nas. V magistrski nalogi smo z metodami in silico vrednotili nevrotoksičnost, razvojno nevrotoksičnost ter teratogenost izbranih topil. Pridobljene podatke za izbrano bazo topil smo primerjali z v podatkovnih bazah pridobljenimi že znanimi in vivo ter in vitro literaturnimi podatki. Raziskovati smo začeli s pomočjo orodij in silico, ki bi v prihodnosti lahko nadomestila ali pa vsaj zmanjšala število raziskav in vivo ter in vitro. Za delo smo izbrali validiran računalniški program Derek Nexus, ki se v začetnih stopnjah razvoja zdravilnih učinkovin (ZU) uporablja za napovedovanje potencialne toksičnosti snovi. V raziskavo smo vključili 244 topil. Derek Nexus snovi kot verjetno toksične prepozna oz. kategorizira na podlagi strukturnih značilnosti molekule ti. toksoforne skupine, ki predstavlja tvegani strukturni element spojine, odgovoren za njen toksični učinek. Napoved je podkrepljena z grafično obrazložitvijo razmerja med strukturo in delovanjem (SAR), s podatki o toksičnosti spojin znotraj SAR, ključnimi referencami in mehanizmi delovanja. Verjetnost toksičnosti za izbrane končne točke je program zaznal pri 40 topilih. V veliki večini primerov je snovi prepoznal kot teratogene (33 topil). Najmanj topil je prepoznal kot razvojno nevrotoksične (2 topili). Kot nevrotoksične pa je napovedal 5 topil. Za vseh 244 topil smo po testiranju in silico za že znane podatke preiskali še podatkovne baze PubChem, PubMed, ScienceDirect ter toksikološke profile spojin. Za izbor že znanih podatkov smo pregledali članke, ki so bili objavljeni od leta 2010 dalje. Po pregledu izbranih podatkovnih baz za literaturne podatke smo, s pomočjo smernic Organizacije za gospodarsko sodelovanje in razvoj (OECD) validacije računskih modelov, ovrednotili napovednost orodja in silico. Ta je dobra, saj so rezultati za točnost več kot 70 %, z vidika specifičnosti pa skoraj 90 % zanesljivi. Manj zanesljivo program sicer napove biološko aktivne spojine. Podoben trend rezultatov smo dobili tudi pri izbranih končnih točkah. Na koncu smo izpostavili še topila, za katera bi zaradi pridobljenih rezultatov, predlagali podrobnejše analize toksičnosti izbranih končnih točk. Osredotočili smo se na topila, pri katerih smo dobili le rezultate in silico. Za topila, pri katerih smo dobili le literaturne podatke, in pa topila, pri katerih smo dobili tako in silico kot tudi literaturne podatke, smo ocenili, da so z vidika končnih točk dobro raziskana.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [T. Harinski], 2021
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
