Faculty of Pharmacy, Lj. (FFALJ)
-
Biološko vrednotenje himernih molekul kot modulatorjev O-GlcNAc transferaze in vitro = In vitro biological evaluation of chimeric O-GlcNAc transferase modulators : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicinaBuhin, AnaPrenos N-acetilglukozamina na akceptorske proteine katalizira encim N-acetil-β-glukozaminil transferaza (OGT), ki uravnava delovanje številnih proteinov ter na ta način omogoča vzdrževanje ... znotrajcelične homeostaze. Neuravnana aktivnost encima OGT je povezana z različnimi bolezni, kot sta rak in sladkorna bolezen, zaradi česar se je pojavila potreba po razvoju orodja za preučevanje vloge encima OGT pri patoloških procesih. Himerni razgrajevalci proteinov (angl. Proteolysis Targeting Chimeras- PROTAC), so molekule sestavljene iz dveh strukturnih ligandov, pri čemer je eden namenjen vezavi na E3 ligazo, drugi pa vezavi na tarčni protein. Le-ti so se v zadnjih letih izkazali kot obetavna alternativa klasičnim zaviralcem, saj ne zavirajo samo delovanja tarčnega proteina, ampak ga s pomočjo naravno prisotnega ubikvitin-proteasomskega sistema tudi usmerjajo v razgradnjo. Številne objavljene študije so pokazale uspešno razgradnjo različnih tarčnih proteinov s pomočjo himernih razgrajevalcev. Na podlagi tega smo sklepali, da bi molekule PROTAC načrtovane za OGT kot tarčni protein lahko razgrajevale le-tega. Z namenom preverjanja naše domneve smo najprej na različnih celičnih linijah vrednotili izražanje encima OGT in E3 ligaz za katere so načrtovani ligandi molekul PROTAC. Na podlagi izražanja encima OGT in E3 ligaz smo za poskuse izbrali celično linijo MDA-MB-231. Morebitno razgradnjo encima OGT smo želeli vrednotiti pri netoksičnih koncentracijah spojin. Zato smo najprej naredili test metabolne aktivnosti na celicah MDA-MB-231, ki so bile 48 ur izpostavljene himernim razgrajevalcem. Ugotovili smo, da molekule PROTAC do 10 µM koncentracije ne delujejo citotoksično. Nato je sledilo vrednotenje učinka razgradnje molekul PROTAC na OGT pri različnih koncentracijah. Rezultati so pokazali, da so na celični liniji MDA-MB-231 le spojine z ligandom za E3 ligazo IAP vodile v delno razgradnjo encima OGT. Najbolj učinkovita je bila spojina SAB417, ki je povzročila razgradnjo OGT že pri 0,1µM koncentraciji. Ta spojina je vodila tudi v znižan nivo N-acetilglukozaminiliranih proteinov, kar dodatno potrjuje, da je prišlo do znižanega delovanja encima OGT. Rezultati kažejo, da smo identificirali himerne razgrajevalce, ki razgrajujejo OGT, a bodo potrebne dodatne modifikacije teh spojin, s katerimi bomo dosegli še bolj učinkovito razgradnjo tarčnega proteina. Le takšne spojine bodo namreč dobra orodja za proučevanje vloge OGT v bioloških in patoloških procesih.Type of material - master's thesis ; adult, seriousPublication and manufacture - Ljubljana : [A. Buhin], 2023Language - slovenianCOBISS.SI-ID - 148325379
Author
Buhin, Ana
Other authors
Gobec, Martina, 1983- |
Smrdel, Lara
Topics
Klinična kemija |
N-acetilglukozaminilacija |
encim OGT |
himerni razgrajevalci |
molekule PROTAC |
celična linija MDA-MB-231
Call number – location, accession no. ... |
Copy status | Reservation |
---|---|---|
Knjižnica mlab 0000000616 BUHIN ANA Biološko 0000000320 IN: 0017645 Knjižnica mlab 616 BUHIN ANA Biološko 320 IN: 0017645 |
available - reading room
|
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
If the library membership card is not in the list,
add a new one.
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Buhin, Ana | |
Gobec, Martina, 1983- | 32034 |
Smrdel, Lara | 55140 |
Source: Personal bibliographies
and: SICRIS
Select pickup location:
Material pickup by post
Delivery address:
Address is missing from the member's data.
The address retrieval service is currently unavailable, please try again.
By clicking the "OK" button, you will confirm the pickup location selected above and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the above pickup location and delivery address, and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the address selected above and complete the reservation process.
Notification
Automatic login and reservation service currently not available. You can reserve the material on the Biblos portal or try again here later.
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Reservation in progress
Please wait a moment.
Reservation was successful.
Reservation failed.
Reservation...
Membership card:
Pickup location: