Retrosintezno zasnovana in silico optimizacija protivirusnih učinkovin z delovanjem na 3C in 3CL proteaze = Retrosynthesis-driven in silico optimization of antiviral agents targeting 3C and 3C-like proteases : univerzitetni študijski program II. stopnje industrijska farmacija
Breznik, Marko, 1994-
Obstaja nujna potreba po razvoju novih rešitev za zdravljenje virusnih bolezni brez komercialno dostopnih zdravil. Raziskave protivirusnih učinkovin ostajajo ključnega pomena in ponujajo osnovo za ...spopadanje z izbruhi virusnih bolezni v prihodnosti, tveganje katerih se ne sme ponovno zanemariti. 3C proteaza (3Cpro) ter funkcionalno in strukturno podobna 3C podobna proteaza (3CLpro) igrata ključno vlogo pri virusni replikaciji in imata izrazito ohranjeno aktivno mesto med različnimi vrstami virusov, zaradi česar sta odlični tarči za zdravljenje pikornavirusnih, kalicivirusnih in/ali koronavirusnih okužb. V tej nalogi opisujemo retrosintezno voden pristop k optimizaciji spojine MLC3 - novega tipa inhibitorja 3Cpro Enterovirusa 68, ki z encimom tvori Meisenheimerjev kompleks. MLC3 domnevno zaseda samo S1 žepek aktivnega mesta. Ker je struktura S1 žepka ena glavnih skupnih značilnosti 3Cpro in 3CLpro, smo po enterovirusno usmerjeni optimizaciji in silico ovrednotili potencial širokospektralnega protivirusnega delovanja izbranih derivatov MLC3. Naš pristop k optimizaciji je bil sestavljen iz dveh metod. Prva metoda je >>rast fragmenta<< - dodajanje substituentov, ki tvorijo dodatne interakcije z aktivnim mestom, hkrati pa ohranjajo že obstoječe interakcije MLC3 ogrodja. Z retrosintezo smo prepoznali komercialno dostopne primarne reaktante za sintezo derivatov in z uporabo analitične platforme ustvarili virtualno knjižnico z 153.675 derivati spojine MLC3. Predstavljamo dve hipotezi o vezavi MLC3 in na njuni podlagi dva farmakoforja, tvorjena z namenom virtualnega rešetanja MLC3 derivatov. Rezultati virtualnega rešetanja so bili sidrani v aktivno mesto 3Cpro. Vsako spojino smo nato ocenili glede na prileganje značilnostim izvirne farmakoforne poizvedbe. Izrazito ugodne interakcije z encimom smo prepoznali pri devetnajstih derivatih, ki so predstavljeni v nalogi. Druga metoda optimizacije je analiza razmerja med strukturno in aktivnostjo >>ogrodja<< - MLC3. V katalogih komercialno dostopnih spojin smo odkrili trinajst strukturnih analogov MLC3, ki so navedeni za nadaljnje in vitro preskuse.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [M. Breznik], 2021
Knjižnica mind 615 BREZNIK MARKO Retrosintezno IN: 0016939
available - reading room
Shelf entry
Adding material to shelf was successful.
Adding material to shelf failed.
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
