VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
-
Novel scaffolds for modulation of NOD2 identified by pharmacophore-based virtual screening [Elektronski vir]Guzelj, Samo ; Tomašič, Tihomir ; Jakopin, ŽigaNucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2 (NOD2) is an innate immune pattern recognition receptor responsible for the recognition of bacterial peptidoglycan fragments. Given its ... central role in the formation of innate and adaptive immune responses, NOD2 represents a valuable target for modulation with agonists and antagonists. A major challenge in the discovery of novel small-molecule NOD2 modulators is the lack of a co-crystallized complex with a ligand, which has limited previous progress to ligand-based design approaches and high-throughput screening campaigns. To that end, a hybrid docking and pharmacophore modeling approach was used to identify key interactions between NOD2 ligands and residues in the putative ligand-binding site. Following docking of previously reported NOD2 ligands to a homology model of human NOD2, a structure-based pharmacophore model was created and used to virtually screen a library of commercially available compounds. Two compounds, 1 and 3, identified as hits by the pharmacophore model, exhibited NOD2 antagonist activity and are the first small-molecule NOD2 modulators identified by virtual screening to date. The newly identified NOD2 antagonist scaffolds represent valuable starting points for further optimization.Vir: Biomolecules [Elektronski vir]. - ISSN 2218-273X (Vol. 12, iss. 8, art. 1054, 2022, 17 str.)Vrsta gradiva - e-članek ; neleposlovje za odrasleLeto - 2022Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 117616387
Avtor
Guzelj, Samo |
Tomašič, Tihomir |
Jakopin, Žiga
Teme
Rak (medicina) |
antagonist |
homology modeling |
NOD2 |
Nucleotide-binding oligomerization |
pharmacophore modeling |
virtual screening |
antagonisti |
modeliranje homologije |
NOD2 |
oligomerizacija, ki veže nukleotide |
modeliranje farmakoforja |
virtualno rešetanje
Avtor | Guzelj, Samo ; Tomašič, Tihomir ; Jakopin, Žiga |
Naslov | Novel scaffolds for modulation of NOD2 identified by pharmacophore-based virtual screening [Elektronski vir] |
Datum objave | 2022-07-29 |
COBISS.SI-ID | 117616387 |
Verzija objave v repozitoriju | Založnikova različica |
Licenca objave v repozitoriju | Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna |
Embargo | Takojšnja javna objava |
Projekti, iz katerih je bila financirana objava
Naziv | Akronim | Številka projekta | Financer |
---|---|---|---|
Razvoj agonistov receptorja NOD2 ter dualnih NOD2/TLR7 agonističnih konjugatov kot novih adjuvansov za cepiva | J3-9256-2018 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Farmacevtska kemija: načrtovanje, sinteza in vrednotenje učinkovin | P1-0208-2022 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Napredna imunološka zdravila in celični pristopi v farmaciji | P1-0420-2022 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
Datoteke, ki spadajo k objavi
Povezava |
---|
https://www.mdpi.com/2218-273X/12/8/1054 |
https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=138680 |
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Guzelj, Samo | 52379 |
Tomašič, Tihomir | 28334 |
Jakopin, Žiga | 26496 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: