VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Načrtovanje novih zaviralcev interakcije protein-protein med Hsp90 in košaperonom Cdc37 = Design of new protein-protein interaction inhibitors between Hsp90 and co-chaperone Cdc37 : magistrska naloga
    Ćosić, Adis
    Rak spada med najsmrtonosnejše bolezni in predstavlja enega izmed največjih izzivov v medicini. Trenutno se za boj s to boleznijo poslužujemo treh metod zdravljenja, in sicer kemoterapije, ... radioterapije in kirurških posegov. Čeprav je ob pravočasni diagnozi določene vrste raka možno uspešno zdraviti ali omejiti, zdravljenje običajno zaradi slabše selektivnosti zdravilnih učinkovin in invazivnosti posegov spremljajo hudi neželeni učinki, ki zmanjšajo kakovost pacientovega življenja. Rak se razvije kot plod številnih dejavnikov, tako genetskih kot dejavnikov okolja. Obstajajo tudi skupne točke različnih vrst raka, ena izmed katerih je opažena povišana koncentracija stresnih proteinov ali proteinov toplotnega šoka (Hsp), ki pripomorejo k preprečevanju apoptoze tumorskih celic in povečanem obsegu njihovega razmnoževanja. Zaviranje delovanja proteinov Hsp se je izkazalo kot učinkovit način zmanjšanja proliferacije tumorskih celic, večina dosedanjih odkritih zaviralcev Hsp pa deluje po mehanizmu kompetitivne inhibicije ATP-vezavne domene, kar je neselektiven način delovanja in lahko pripelje do škodljive indukcije odziva toplotnega šoka. Predmet novejših raziskav predstavlja šaperon Hsp90, ki se v kompleksih s košaperoni pojavlja kot pomemben člen pri razvoju številnih karcinomov. Tema magistrske naloge je načrtovanje novih zaviralcev protein-protein interakcije (PPI) med Hsp90 in košaperonom Cdc37, ki bi delovali selektivno in povzročali manj neželenih učinkov. Odkrivanja novih zaviralcev Hsp90 smo se lotili z uporabo računalniških metod virtualnega rešetanja in molekulskega sidranja v vezavno mesto na Hsp90. Sprva smo z vezavo že znanega zaviralca PPI Hsp90-Cdc37, DDO-5936, validirali uporabljeno programsko opremo. Nato smo se lotili sidranja treh spojin, odkritih na Fakulteti za farmacijo, ki so izkazovale antiproliferativni učinek na rakavih celicah. Sledeči korak je bil rešetanje knjižnic spojin in sidranje dobljenih zadetkov. V končni stopnji smo rešetali še knjižnico z več kot 3,2 milijoni komercialno dostopnih spojin s programom ROCS in nato še s programom EON ter primerjali prileganja dobljenih spojin s spojino 18h, ki je prav tako zaviralec preiskovane PPI z močnejšo afiniteto do vezavnega mesta kot DDO-5936. Rezultati so pokazali, da se nobena od sidranih spojin ne veže podobno kot spojina DDO-5936, prav tako zadetki virtualnih rešetanj niso zadostno strukturno in elektrostatsko podobni spojini 18h, da bi sklepali na podobno vezavo in učinek. Ugotovitve naše naloge predstavljajo podlago za optimizacijo spojin in generiranje novih knjižnic za nadaljnja rešetanja in raziskave.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [A. Ćosić], 2022
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 124020739

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...