VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Odkrivanje novih alosteričnih zaviralcev bakterijske DNA-giraze z računalniškimi metodami = Computer-aided discovery of potential allosteric inhibitors of bacterial DNA gyrase : magistrski študijski program Industrijska farmacija
    Pintar, Tadeja, kemičarka
    Odkritje protibakterijskih učinkovin je pomembna prelomnica človeštva. Žal, pa so bakterije že kmalu po odkritju prvih protibakterijskih učinkovin proti njim postale odporne. Število proti ... protibakterijskim učinkovinam odpornih bakterij vztrajno narašča, zato se danes srečujemo z veliko težavo. Ocena Evropske komisije kaže, da letno v Evropi zaradi okužb s proti protibakterijskim učinkovinam odpornimi bakterijami umre 33.000 ljudi. Večjo skrb povzročajo po Gramu negativne bakterije, saj proti njim že nekaj desetletij ni bilo razvitih protibakterijskih učinkovin z novimi mehanizmi delovanja. Eden glavnih razlogov za pomanjkanje novo razvitih protibakterijskih učinkovin je pomanjkanje novih spojin vodnic, seveda pa k temu pripomore tudi kompleksnost razvoja, skupaj z velikimi stroški in s slabo povrnitvijo investicije. V boju proti bakterijski odpornosti sta priporočena zmanjšanje nepotrebne uporabe protibakterijskih sredstev ter odkrivanje in razvoj novih protibakterijskih učinkovin. Ena izmed zanimivih tarč za razvoj novih protibakterijskih učinkovin je DNA-giraza. Trenutno najbolj znani zaviralci DNA-giraze so kinoloni. Gre za širokospektralne protibakterijske učinkovine, ki se vežejo na DNA in DNA-girazo ter stabilizirajo kompleks. Žal, pa se odpornost bakterij proti fluorokinolonom neprestano veča, zato iščemo nove zaviralce DNA-giraze. V sklopu magistrske naloge smo iskali nove alosterične zaviralce DNA-giraze s pomočjo računalniških metod. Kot izhodiščno spojino smo uporabili znan alosterični zaviralec DNA-giraze. Delo smo razdelili na dva dela. Najprej smo izvedli virtualno rešetanje na osnovi strukture liganda, kasneje pa še na osnovi strukture kompleksa encim - ligand. Pri rešetanju na osnovi strukture liganda smo spojinam iz knjižnice spojin določili podobnost z izhodiščnim znanim zaviralcem DNA-giraze. Pri tem smo ocenili podobnost po funkcionalnih skupinah in površini/obliki molekule, v nadaljevanju pa tudi elektrostatsko podobnost. Zadetke posameznih rešetanj smo analizirali in jih predstavili v magistrskem delu. Izbrali smo tudi nekaj strukturno različnih spojin, jih naročili in testirali njihovo zaviralno delovanje na DNA-girazi iz bakterije Escherichia coli v in vitro sistemu. Testiranje je pokazalo, da izbrane spojine v koncentracijah 10 in 100 µM, žal, ne zavirajo delovanja DNA-giraze iz E. coli.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [T. Pintar], 2022
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 125796611

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...

Vnos na polico