VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Biološko vrednotenje himernih molekul kot modulatorjev O-GlcNAc transferaze in vitro = In vitro biological evaluation of chimeric O-GlcNAc transferase modulators : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicina
    Buhin, Ana
    Prenos N-acetilglukozamina na akceptorske proteine katalizira encim N-acetil-β-glukozaminil transferaza (OGT), ki uravnava delovanje številnih proteinov ter na ta način omogoča vzdrževanje ... znotrajcelične homeostaze. Neuravnana aktivnost encima OGT je povezana z različnimi bolezni, kot sta rak in sladkorna bolezen, zaradi česar se je pojavila potreba po razvoju orodja za preučevanje vloge encima OGT pri patoloških procesih. Himerni razgrajevalci proteinov (angl. Proteolysis Targeting Chimeras- PROTAC), so molekule sestavljene iz dveh strukturnih ligandov, pri čemer je eden namenjen vezavi na E3 ligazo, drugi pa vezavi na tarčni protein. Le-ti so se v zadnjih letih izkazali kot obetavna alternativa klasičnim zaviralcem, saj ne zavirajo samo delovanja tarčnega proteina, ampak ga s pomočjo naravno prisotnega ubikvitin-proteasomskega sistema tudi usmerjajo v razgradnjo. Številne objavljene študije so pokazale uspešno razgradnjo različnih tarčnih proteinov s pomočjo himernih razgrajevalcev. Na podlagi tega smo sklepali, da bi molekule PROTAC načrtovane za OGT kot tarčni protein lahko razgrajevale le-tega. Z namenom preverjanja naše domneve smo najprej na različnih celičnih linijah vrednotili izražanje encima OGT in E3 ligaz za katere so načrtovani ligandi molekul PROTAC. Na podlagi izražanja encima OGT in E3 ligaz smo za poskuse izbrali celično linijo MDA-MB-231. Morebitno razgradnjo encima OGT smo želeli vrednotiti pri netoksičnih koncentracijah spojin. Zato smo najprej naredili test metabolne aktivnosti na celicah MDA-MB-231, ki so bile 48 ur izpostavljene himernim razgrajevalcem. Ugotovili smo, da molekule PROTAC do 10 µM koncentracije ne delujejo citotoksično. Nato je sledilo vrednotenje učinka razgradnje molekul PROTAC na OGT pri različnih koncentracijah. Rezultati so pokazali, da so na celični liniji MDA-MB-231 le spojine z ligandom za E3 ligazo IAP vodile v delno razgradnjo encima OGT. Najbolj učinkovita je bila spojina SAB417, ki je povzročila razgradnjo OGT že pri 0,1µM koncentraciji. Ta spojina je vodila tudi v znižan nivo N-acetilglukozaminiliranih proteinov, kar dodatno potrjuje, da je prišlo do znižanega delovanja encima OGT. Rezultati kažejo, da smo identificirali himerne razgrajevalce, ki razgrajujejo OGT, a bodo potrebne dodatne modifikacije teh spojin, s katerimi bomo dosegli še bolj učinkovito razgradnjo tarčnega proteina. Le takšne spojine bodo namreč dobra orodja za proučevanje vloge OGT v bioloških in patoloških procesih.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [A. Buhin], 2023
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 148325379

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...

Vnos na polico