-
Protein solubility classification in biomedical concept space : doktor of philosophy thesis = Klasifikacija topnosti proteinov v prostoru biomedicinskih konceptov tekstovne analize : doktorska disertacijaKocbek, SimonProteini so pomemben del vsakega organizma in imajo številne pomembne funkcije, katere so v veliki meri odvisne od strukture proteina. Zadnja je mnogokrat predmet raziskav, kjer strokovnjaki ... izolirajo posamezen protein in proučijo njegove strukturne lastnosti. Na proces izolacije proteina v veliki meri vpliva njegova topnost, saj je protein z nizko stopnjo topnosti zelo težko izolirati. Prav tako so netopni proteini razlog za nekatere pomembne bolezni. Zaradi teh razlogov želijo strokovnjaki velikokrat vnaprej vedeti, kateri proteini imajo več možnosti za visoko stopnjo topnosti. Posledično so se razvile številne metode, ki uporabljajo tehnike nadzorovanega strojnega učenja za klasifikacijo topnosti proteinov. Te metode klasificirajo proteine vtopne in ne-topne ter se uporabljajo za napovedovanje topnosti za nove primerke. V disertaciji predlagamo novo metodo za klasifikacijo topnosti proteinov, ki s pomočjo tehnik tekstovnega rudarjenja izlušči medicinsko znanje iz strokovne literature in ga predstavi v obliki atributov. Te atributepoimenujemo atributi biomedicinskih konceptov in predstavljajo novost na področju klasifikacije topnosti proteinov. Do sedaj uporabljene metode so namreč omejene z uporabo atributov, ki so večinoma izpeljani le iz sekvence proteina. V okviru disertacije tako podamo številne znanstvene prispevke. Predlagana je metoda za ekstrakcijo atributov biomedicinskih konceptov iz strokovne literature na podlagi imena oziroma identifikacijske številke proteina. Nadalje ponudimo originalno primerjavo metod, ki uporabljajo nove atribute, z metodami, ki ponujajo že uveljavljene atribute izpeljane iz sekvence proteina. Kot se pokaže v disertaciji, novi atributi doprinesejo k uspešnosti klasifikacije topnosti proteinov. Podan je tudi algoritem za implementacijo najuspešega klasifikatorja z atributi biomedicinskih konceptov.Zadnji prispevek vključuje novo medicinsko znanje, ki ponudi indice o tem, katere skupine besed in besednih zvez iz strokovne literature so najbolj povezane s topnostjo proteinov. Disertacija je sestavljena iz skupno osem poglavij, katera podrobno predstavijo teoretično ozadje področij, kot so nadzorovano strojno učenje, tekstovno rudarjenje ter struktura in topnost proteinov. Obsežen del disertacije je namenjen opisu proteinskih podatkovnih baz, ki ponujajo informacije o topnosti proteinov ter opisu razvite metode in njene primerjave z do sedaj uporabljanimi metodami. Izvedena je empirična primerjava dvajsetih baz sekvenčnih atributov, ki jim postopoma dodajamo nove atribute in spremljamo doprinose k uspešnosti treh pogosto uporabljanih klasifikacijskih metod.Vrsta gradiva - disertacija ; neleposlovje za odrasleZaložništvo in izdelava - [Maribor : S. Kocbek], 2011Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 15496470
Povezava(-e):
Digitalna knjižnica Univerze v Mariboru – DKUM
Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.siDostop z namenskih računalnikov v prostorih NUK
Avtor
Kocbek, Simon
Drugi avtorji
Kokol, Peter, 1957- |
Garcia de la Banda, Maria
Teme
strojno učenje |
klasifikacija topnosti proteinov |
biomedicinski koncept |
izbira atributov |
tekstovno rudarjenje |
machine learning |
protein solubility |
classification |
biomedical concept |
feature selection |
text mining
Knjižnica/institucija |
Kraj | Akronim | Za izposojo | Druga zaloga |
---|---|---|---|---|
Knjižnica tehniških fakultet, Maribor | Maribor | KTFMB |
v čitalnico 1 izv.
|
|
Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana | Ljubljana | NUK |
v čitalnico 1 izv.
|
ni za izposojo 1 izv.
|
Univerzitetna knjižnica Maribor | Maribor | UKM |
v čitalnico 1 izv.
|
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Kocbek, Simon | 28427 |
Kokol, Peter, 1957- | 03782 |
Garcia de la Banda, Maria |
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Obvestilo
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Prosimo, počakajte trenutek.