VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
-
Odkrivanje novih zaviralcev kalijevih kanalčkov hEAG1 z virtualnim rešetanjem na podlagi strukture tarče = Discovery of novel hEAG1 potassium channel inhibitors using structure-based virtual screening : enoviti magistrski študijski program FarmacijaBračko, TineRakava obolenja so drugi najpogostejši vzrok smrti v Sloveniji in ostalem razvitem svetu in s tem eden največjih javnozdravstvenih problemov. Tarčna terapija je pristop molekularne medicine za ... zdravljenje tovrstnih bolezni, ki interferira s specifičnimi celičnimi strukturami, udeleženimi v karcinogenezi. Učinkuje po različnih mehanizmih, med katerimi je tudi ustavitev proliferacije rakavih celic. Slednjo lahko dosežemo z blokado celičnih struktur, ki so udeležene pri delitvi rakavih celic. Mednje spada humani napetostno odvisni kalijev kanalček iz družine 'ether-à-go-go' (hEAG1), ki je odgovoren za regulacijo celičnega cikla. hEAG1 posredno omogoči tvorbo delitvenega vretena v delečih se celicah. Prav tako je v celicah udeležen pri vzdrževanju mirovnega membranskega potenciala. Ekspresija kanalčka je povečana v tumorskih celicah več kot 70% vseh vrst tumorjev. hEAG1 igra pomembno vlogo pri preživetju, rasti in delitvi tumorskih celic. Z njegovo inhibicijo je možno doseči smrt tumorskih celic, zato je pomembna tarča raziskav. Strukturno gledano je kanalček hEAG1 transmembranski tetramerni protein, ki ga fiziološko najdemo predvsem v nevronih. Po zgradbi je zelo soroden kanalčku hERG, ki je odgovoren za repolarizacijo srčnih celic. Selektivna inhibicija kanalčka hEAG1 še vedno predstavlja veliko težavo, saj se večina ligandov veže hkrati tudi na kanalček hERG, s čimer se poveča tveganje za nastanek aritmije. V okviru magistrske naloge smo z metodami računalniške kemije skušali poiskati nove selektivne zaviralce kanalčka hEAG1. Z vizualno preiskavo struktur kanalčkov hEAG1 in hERG ter analizo njunih aminokislinskih zaporedij smo primerjali oba kanalčka. V regijah kanalčkov, v katerih smo ugotovili strukturne razlike, smo ustvarili vezavne žepe in v dva najbolj specifična žepa, ki sta bila lastna kanalčku hEAG1, izvedli virtualno rešetanje s sidranjem. Oba vezavna žepa sta bila del senzorja napetosti v kanalčku. Za najboljših sto spojin zadetkov virtualnega rešetanja v vsakem žepu smo generirali farmakoforne modele. V prvem žepu so bile interakcije izključno hidrofobne, v drugem pa so modeli vsebovali še eno ionsko interakcijo, donor in akceptor vodikove vezi. Proučili smo še specifičnost aminokislin v okolici vezavnih žepov s primerjavo s kanalčkom hERG. Ugotovili smo, da so v prvem žepu specifične tri, v drugem pa dve aminokislini v kanalčku hEAG1. Na osnovi rezultatov sidranja smo zaključili, da spojin zadetkov ni smiselno testirati in vitro zaradi majhne verjetnosti, da bi se v izbrane vezavne žepe vezale z veliko afiniteto in močnimi interakcijami ter imele ustrezno selektivnost.Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasleZaložništvo in izdelava - Ljubljana : [T. Brečko], 2023Jezik - slovenskiCOBISS.SI-ID - 157040387
Avtor
Bračko, Tine
Drugi avtorji
Tomašič, Tihomir
Teme
Tarčna zdravila |
Rak (medicina) |
hEAG1 |
hERG |
novi zaviralci KV10.1 |
molekulsko sidranje
Knjižnica/institucija |
Kraj | Akronim | Za izposojo | Druga zaloga |
---|---|---|---|---|
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana | Ljubljana | FFALJ |
v čitalnico 1 izv.
|
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Bračko, Tine | |
Tomašič, Tihomir | 28334 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: