-
The influence of storage conditions and DNA extraction protocol on the results of molecular analysis of the European spruce bark beetle (Ips typographus L.) = Vpliv postopkov shranjevanja in ekstrakcije celokupne DNA na rezultate molekularne analize osmerozobega smrekovega lubadarja (Ips typographus L.)Devetak, Zina ...Za uspeh molekularne identifikacije podlubnikov je ključna zadostna količina kakovostnega ekstrakta DNA. Pri raziskavi vrste smo se osredotočili na vpliv različnih postopkov shranjevanja osebkov Ips ... typographus(L.) in različnih protokolov ekstrakcije DNA na količino in kakovost DNA, namenjene za uporabo v molekularni diagnostiki. Odrasle hrošče smo zamrznili pri -20 °C na dva načina, v etanolu in na suho. Ekstrakcije smo opravili po štirih različnih postopkih. Primerjali smo količino pridobljene DNA. Kakovost ekstrahirane DNA smo ocenili s polimerazno verižno reakcijo in sekvenciranjem po Sangerju. Način shranjevanja ni statistično značilno vplival na količino pridobljene DNA. DNA višje kakovosti smo pridobili iz hroščev, ki so bili zamrznjeni v etanolu. Le dva postopka ekstrakcije DNA sta dala DNA, uporabno za sekvenciranje. V količini pridobljene DNA se pri sekvenciranju uspešna postopka nista pomembno razlikovala. Določili smo optimalno kombinacijo postopkov shranjevanja v etanolu pri -20 °C in ekstrakcije celokupne DNA z ekstrakcijskim kitom Nucleospin Insect DNA proizvajalca Macherey Nagel, ki omogoča časovno učinkovito identifikacijo.Vir: Acta Silvae et Ligni. - ISSN 2335-3112 ([Št.] 132, 2023, str. 29-38)Vrsta gradiva - članek, sestavni delLeto - 2023Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 180304131
Avtor
Devetak, Zina |
Kavčič, Andreja, biologinja |
De Groot, Maarten, entomolog |
Piškur, Barbara, 1979-
Teme
zgodnje zaznavanje |
shranjevanje osebkov |
ekstrakcijski postopek |
polimerazna verižna reakcija |
PCR |
sekvenciranje po Sangerju |
molekularna diagnostika |
early detection |
specimen storage |
total DNA extraction |
PCR |
polymerase chain reaction |
Sanger sequencing |
molecular diagnostics
Avtor | Devetak, Zina ... |
Naslov | The influence of storage conditions and DNA extraction protocol on the results of molecular analysis of the European spruce bark beetle (Ips typographus L.) = Vpliv postopkov shranjevanja in ekstrakcije celokupne DNA na rezultate molekularne analize osmerozobega smrekovega lubadarja (Ips typographus L.) |
Datum objave | 2023-12-31 |
COBISS.SI-ID | 180304131 |
Verzija objave v repozitoriju | Založnikova različica |
Licenca objave v repozitoriju | Creative Commons Priznanje avtorstva-Deljenje pod enakimi pogoji 4.0 Mednarodna |
Embargo | Takojšnja javna objava |
Projekti, iz katerih je bila financirana objava
Naziv | Akronim | Številka projekta | Financer |
---|---|---|---|
Gozdna biologija, ekologija in tehnologija | P4-0107-2020 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Administration of the Republic of Slovenia for Food Safety, VeterinarySector and Plant Protection | C2337-21-000016 | ||
Administra-tion of the Republic of Slovenia for Food Safety, VeterinarySector and Plant Protection | C2337-22-000020 | ||
Javna gozdarska služba | JGS | JGS |
Ministrstvo za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano |
Datoteke, ki spadajo k objavi
Povezava |
---|
https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?id=18084 |
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Devetak, Zina | 32514 |
Kavčič, Andreja, biologinja | 33222 |
De Groot, Maarten, entomolog | 29092 |
Piškur, Barbara, 1979- | 25448 |
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Obvestilo
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Prosimo, počakajte trenutek.