VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Vpliv sprememb G-kvadrupleksa v promotorju gena TNFSF11 na njegovo aktivnost = The study of G-quadruplex changes in TNFSF11 gene promoter on its activity ; magistrska naloga : enoviti magistrski študij farmacije
    Borovnik, Rebeka, 1993-
    Obnavljanje kostnega tkiva je uravnano z različnimi mehanizmi in dejavniki, med katerimi ima pomembno vlogo sistem RANK/RANKL/OPG. V primeru neustreznega uravnavanja tega sistema se lahko poveča ... izražanje proteina RANKL in s tem neposredno zveča nastajanje in aktivnost osteoklastov, kar poveča razgradnjo kostnine in lahko vodi v nastanek kostnih bolezni, npr. osteoporoze. Pri uravnavanju izražanja gena za protein RANKL (TNFSF11) ima pomembno vlogo promotorska regija, saj v svojem zapisu vsebuje regulatorne elemente. Ti omogočajo vezavo različnih transkripcijskih faktorjev in tako pospešijo ali zavrejo izražanje RANKL. V promotorski regiji gena TNFSF11 se nahaja tudi struktura, imenovana G-kvadrupleks, za katero je bilo že v številnih študijah ugotovljeno, da ima velik vpliv na izražanje različnih genov. Namen magistrske naloge je bil ugotoviti, kakšen je vpliv G-kvadrupleksa in sprememb v njegovem zaporedju na aktivacijo promotorske regije v genu za RANKL (TNFSF11). Dodatno smo želeli proučiti vpliv SNP-jev rs2296533 in rs9533157, ki se nahajata v bližini G-kvadrupleksa in ugotoviti, ali imajo tudi spremembe na tem mestu vpliv na aktivacijo promotorja. Za analizo vpliva G-kvadrupleksa na aktivnost promotorja gena TNFSF11 smo naredili mutacijsko analizo promotorske regije in izmerili aktivnost mutiranega in nemutiranega promotorja s pomočjo dvojnega luciferaznega testa v treh sesalskih celičnih linijah % HeLa, A549 in HOS. Pri delu smo uporabljali plazmidne vektorje pGL3, ki so vsebovali del zapisa promotorske regije gena TNFSF11. Z mutagenezo smo v promotorju gena TNFSF11 ustvarili mutacije na različnih delih G-kvadrupleksa, mutirali smo tudi polimorfna mesta rs2296533 in rs9533157. Pripravljene plazmidne vektorje smo nato s postopkom transfekcije vnesli v vse tri sesalske celične linije. Sledilo je merjenje njihovega vpliva na aktivacijo promotorske regije gena TNFSF11 s pomočjo dvojnega luciferaznega testa. Vnesene mutacije so povečale (RANGdel, RANG1T, RANG4T, RANG1234T ter posamezna SNP-ja rs2296533 in rs9533157) oz. zmanjšale aktivnost (RANG2713T in dvojna mutacija rs2296533, rs9533157) promotorja v sesalskih celičnih linijah HeLa in A549, v celicah HOS pa njihov vpliv ni bil tako izrazit. Naši rezultati so pokazali, da G-kvadrupleks z normalnim zaporedjem nukleotidov znižuje aktivnost promotorja in že najmanjša sprememba v zaporedju močno spremeni njegovo delovanje. Z analizo SNP-jev (rs2296533 in rs9533157) smo ugotovili, da tudi ta dva polimorfizma vplivata na aktivnost promotorja za RANKL. Naše ugotovitve potrjujejo, da je tudi tridimenzionalna struktura nukleotidnih zaporedij pomembna za aktivnost promotorja in lahko doprinese k boljšemu genetskemu odkrivanju posameznikov s povečano kostno razgradnjo oziroma s povečanim tveganjem za osteoporozo.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [R. Borovnik], 2018
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 4544625

    Povezava(-e):

    Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...

Vnos na polico