VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Priprava podatkovne zbirke izvencelične mikro RNA v serumu in plazmi = Design of extracellular micro RNA database in serum and plasma : enoviti magistrski študij farmacija
    Praznik, Ajda, farmacevtka
    Mikro RNA (miRNA) so endogene, enoverižne RNA, ki uravnavajo izražanje genov in so pomembne pri številnih fizioloških in patoloških procesih (1,2). Kljub temu, da so miRNA v serumu oziroma plazmi ... privlačne kot obetavni diagnostični biooznačevalci, velik problem predstavlja njihova številčnost, tkivna nespecifičnost in posledično slaba korelacija med profilom mikro RNA in neko določeno boleznijo. Na podlagi sistematičnega pregleda objav o diagnostični uporabnosti miRNA v serumu in plazmi, smo pripravili zbirno tabelo miRNA s pripadajočo diagnostično uporabnostjo, diagnostičnimi parametri kot so specifičnost, občutljivost, natančnost in površina pod ROC krivuljo. Te smo nadalje statistično ovrednotili z metaanalizo, pri čemer smo uporabili programsko opremo Metadisc 1.40. Na osnovi ključnih besed smo oblikovali iskalni profil: ("microRNA"[All Fields] OR "miRNA"[All Fields]) AND ("diagnosis"[All Fields] OR "biomarker"[All Fields]) AND ("serum"[All Fields] OR "plasma"[All Fields]) NOT Review[ptyp] in v njem zajeli 2588 objav. Na osnovi predhodno oblikovanih vključitvenih in izključitvenih kriterijev smo delo nadaljevali s 437 objavami. V teh raziskavah smo preučevali skupno 467 miRNA in njihovih kombinacij. V pripravo ocene diagnostične uporabnosti smo vključili 290 posameznih in 177 kombinacij miRNA. Nadalje smo pridobljene podatke razdelili v štiri podskupine: rak dojke, rak debelega črevesa, nevrodegenerativne bolezni in mišično-skeletne bolezni in jih ločeno ovrednostili z metaanalizo. Metaanaliza podskupin je pokazala, da so skupne vrednosti občutljivosti in specifičnosti, kot merilo učinkovitosti diagnostičnega testa, pri odkrivanju raka dojke znašale 82,8 % in 77,5 %, pri raku debelega črevesja 77,8 % in 78,3 %, pri nevrodegenerativnih boleznih 81,1% in 78,4 % ter pri odkrivanju mišično-skeletnih bolezni 82,4 % in 81,2 %. Površina pod ROC krivuljo, ki klasifikatorje razvršča na osnovi njihovih sposobnosti napovedovanja bolezni, je znašala 0,9108 za napovedovanje raka dojke, 0,8734 za napovedovanje raka debelega črevesja, 0,9015 za napovedovanje nevrodegenerativnih bolezni in 0,8951 pri napovedi mišično-skeletnih bolezni. Posebej natančno smo ovrednotili povezanost mikro RNA za diagnosticiranje Alzheimerjeve bolezeni. MiRNA iz naše podatkovne zbirke smo primerjali s podatki o izražanju miRNA pri bolnikih z Alzheimerjevo boleznijo in pri zdravih kontrolah. S statističnim t testom smo ugotovili, da so štiri miRNA: miRNA-125b(p = 0,05), miRNA-142-3p (p = 0,0002), miRNA-483-3p (p = 0,05) in miRNA-483-5p (p = 0,04) diagnostično učinkovite pri prepoznavanju bolnikov z Alzheimerjevo boleznijo. Na podlagi rezultatov lahko zaključimo, da so miRNA iz podatkovne zbirke diagnostično uporabne. Za namen širše rabe zbirke podatkov smo pripravili tudi spletno aplikacijo, ki bo omogočala lažje iskanje in dostop do podatkov o vrsti ter uporabnosti miRNA v diagnostične namene.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [A. Praznik], 2019
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 4861809

    Povezava(-e):

    https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=113180

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...

Vnos na polico