VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Uporaba različnih izborov spremenljivk za modeliranje antioksidativne aktivnosti serije derivatov pulvinske kisline in kumarinov z uporabo protitočnih nevronskih mrež
    Martinčič, Rok ...
    Odkrivanje novih antioksidantov je pomembna naloga, saj le-ti preko zaščite DNK in proteinov upočasnijo oz. preprečijo razvoj rakavih bolezni, nevrodegenerativnih bolezni ter staranja. Z in silico ... pristopom želimo ustvariti model za predvidevanje antioksidativne aktivnosti spojin, na podlagi izmerjenih aktivnosti derivatov pulvinske kisline in kumarinov. Model bi naj bil uporabljan za predvidevanje aktivnosti novih derivatov teh spojin. Za modeliranje smo za vsako spojino izračunali v povprečju 350 deskriptorjev. Izločili smo deskriptorje, pri katerih se pojavljajo manjkajoče vrednosti, tiste, ki imajo varianco manjšo od 0,0001, ter tiste, ki med sabo močno korelirajo. Uporabili smo 3 načine izbora spremenljivk; prvi izbor smo izvedli s pomočjo statističnega Mann- Whitneyevega testa, drugega s pomočjo genetskega algoritma ter tretjega S kombinacijo obeh metod. S pomočjo umetnih nevronskih mrež smo z izbranimi deskriptorji poskušali postaviti čim boljše modele. Razvili smo jih z uporabo protitočnih nevronskih mrež (CP-ANN) ter interno validirali s pomočjo navzkrižne validacije (10-fold cross- validation). Najboljši modeli (izbor 1, 35 deskriptorjev, R2trening= 0,545, Rcv = 0,230; izbor 2, 10 deskriptorjev, R2'trening= 0,755, Rcv = 0,540; izbor 3, 15 deskriptorjev, R2trening= 0,700, Rcv = 0,523) so bili izbrani na podlagi največjega navzkrižno-validacijskega koeficienta (Rev). V nasprotju s prvim modelom, ki ima očitno nizko napovednomoč (Rev < 0,5), izkazujeta drugi in tretji model dobro sposobnost napovedovanja antioksidativne aktivnosti novih derivatov pulvinske kisline in kumarinov.
    Vir: Zbornik povzetkov referatov s posvetovanja (Str. 101)
    Vrsta gradiva - prispevek na konferenci
    Leto - 2012
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 5066778

Vnos na polico