VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Računalniška analiza encima MurA in njegovih zaviralcev z vidika načrtovanja novih protibakterijskih učinkovin = Computational analysis of the MurA enzyme and its inhibitors from the perspective of antibacterial agents design : enoviti magistrski študijski program Farmacija : Uniform Master's Study Programme Pharmacy
    Fazlić, Merima
    Antibiotiki se uporabljajo približno 60 let in lahko zdravijo praktično vse danes poznane okužbe. Žal njihovo uporabo spremlja pojav odpornosti in posledično živimo v času, ko so bakterije razvile ... odpornost na večino antibiotikov. Pri bakterijah je celična stena tista, ki predstavlja ključni strukturni element in tako idealno tarčo pri odkrivanju in razvoju novih antibiotikov. S tem namenom smo se odločili za poseg v sintezo peptidoglikana, saj je le-ta prisoten v prokariontskih celicah in tako omogoča optimalno selektivno ciljanje mikrobnih vitalnih poti. Osredotočili smo se na encim MurA, ki katalizira prvi korak v biosintezi peptidoglikana tako grampozitivnih kot tudi gramnegativnih bakterijah. Pri izdelavi magistrske naloge smo uporabljali različna bioinformacijska orodja, s katerimi smo podrobneje analizirali encim. V prvem delu smo preverjali, ali je encim MurA esencialen za rast, razvoj in preživetje večine bakterij. Temu je sledilo preučevanje evolucijsko ohranjenih aminokislin in identifikacija vezavnih mest, s pomočjo katerega smo določili ključne aminokisline, pomembne za uspešno molekulsko sidranje spojin v aktivno mesto in razvoj potencialne protimikrobne učinkovine. V zadnjem delu smo preverili podatke o potencialnih zaviralcih encima in ovrednotili njihove fizikalno-kemijske lastnosti, lipofilnost, topnost v vodi, farmakokinetične lastnosti, podobnost z učinkovinami ter farmacevtsko-kemijske lastnosti. Pridobljene podatke smo z uporabo različnih programov tudi vizualizirali. Izkazalo se je, da je esencialnost gena MurA dokazana v enaindvajsetih različnih organizmih. S presekom aminokislin z najvišjim odstotkom evolucijske ohranjenosti in aminokislin z najvišjim odstotkom interakcij preko vodikovih vezi, smo kot končni rezultat dobili deset ključnih aminokislin: Lys-22, Asn-23, Asp-49, Arg-91, Arg-120, Glu-188, Thr-304, Asp-305, Arg-331, Arg-397. S pomočjo molekulskih deskriptorjev smo nato ovrednotili osemindvajset znanih zaviralcev encima MurA in naredili izbor treh spojin, ki izkazujejo najboljše lastnosti in so zato najbolj perspektivne za nadaljnji razvoj.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [M. Fazlić], 2021
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 58501635

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...